Protein–RNA interactions for Protein: Q10570

CPSF1, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,443 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF1Q10570 AC092634.7-201ENST00000621022 103 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MTND5P33-201ENST00000571250 1450 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU5B-1-201ENST00000363286 116 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR660-201ENST00000385235 97 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MTND4LP7-201ENST00000431728 294 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL589678.1-201ENST00000452685 561 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-677P-201ENST00000516914 101 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL391903.3-201ENST00000612158 163 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL354696.1-201ENST00000614652 497 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 U6.42-201ENST00000618440 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC024940.5-201ENST00000622889 474 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORA2.2-201ENST00000365473 135 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNA5SP323-201ENST00000391094 133 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC116347.2-201ENST00000514912 523 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORA25.12-201ENST00000516202 82 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC024382.1-201ENST00000520224 292 ntTSL 3 BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 DEFB108A-201ENST00000530110 222 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL022154.1-201ENST00000604698 785 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC124016.2-201ENST00000610058 665 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL031667.3-201ENST00000620124 655 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-853P-201ENST00000364306 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 VPS26BP1-201ENST00000417155 755 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 STAG3L5P-204ENST00000443759 179 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC109445.1-201ENST00000512356 383 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-1146P-201ENST00000516282 102 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNY4P16-201ENST00000364768 94 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 DEFB130D-201ENST00000426866 237 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL606517.2-201ENST00000442855 241 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SEPT14P24-201ENST00000447236 180 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-1096P-201ENST00000517089 102 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC021451.1-201ENST00000523498 1129 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC104408.1-201ENST00000605241 170 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC104073.3-201ENST00000610942 955 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR8054-201ENST00000620877 86 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC099654.8-201ENST00000637757 681 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-289P-201ENST00000364093 107 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU4-22P-201ENST00000411058 166 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 ELOCP24-201ENST00000456370 334 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 snoU13.25-201ENST00000458945 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU6-917P-201ENST00000516294 104 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC022868.1-201ENST00000517767 391 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC093027.1-201ENST00000546698 429 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 ZNF321P-202ENST00000550843 495 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AC090186.1-201ENST00000605991 572 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 AL121904.1-201ENST00000611894 948 ntTSL 5 BASIC-0.34□□□□□ -2.46
CPSF1Q10570 SNORD114-28-201ENST00000363610 72 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU6-440P-201ENST00000390882 105 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC092802.2-202ENST00000444665 371 ntTSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC119751.4-201ENST00000507498 357 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02267-202ENST00000522173 799 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC087883.1-201ENST00000551882 391 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC012404.2-201ENST00000558572 481 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR4778-201ENST00000577635 80 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC234772.3-201ENST00000602277 528 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC004832.4-201ENST00000608952 331 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 AC015726.2-201ENST00000620112 122 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 MIR6079-201ENST00000635807 62 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 RNA5SP331-201ENST00000364986 107 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
CPSF1Q10570 SNORA40.8-201ENST00000411034 126 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
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