Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 TSGA10-205ENST00000410001 3036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 EIF1P2-201ENST00000428233 350 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC244670.1-201ENST00000436879 112 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6ATAC13P-201ENST00000516152 131 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 Y_RNA.713-201ENST00000517013 96 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 NKAIN2-205ENST00000546092 148 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC091152.3-201ENST00000604227 325 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC002064.3-201ENST00000623448 346 ntBASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.55□□□□□ -2
PGGT1BP53609 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-212P-201ENST00000362642 104 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD27-201ENST00000363981 72 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD21-201ENST00000383953 95 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MIR10B-201ENST00000385011 110 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD78.2-201ENST00000391076 69 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AL590135.1-201ENST00000422215 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC021491.3-201ENST00000513378 156 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 GTF3AP2-201ENST00000557014 266 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC004944.1-201ENST00000517807 3059 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MAP3K2-203ENST00000409947 10992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC2.54□□□□□ -2
PGGT1BP53609 OR4K2-204ENST00000641885 8681 ntAPPRIS P1 BASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 U8.9-201ENST00000365667 134 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 Y_RNA.541-201ENST00000384640 113 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-19P-201ENST00000384718 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD115-46-201ENST00000390982 71 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SNORD12B-201ENST00000410433 91 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC009414.1-201ENST00000427200 443 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 SCARNA11.3-201ENST00000517276 130 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 EIF4BP1-201ENST00000554881 351 ntBASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 AC009120.5-201ENST00000561669 475 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
PGGT1BP53609 TAB2-201ENST00000367456 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 ANKAR-201ENST00000313581 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-529P-201ENST00000363383 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-1285P-201ENST00000363480 105 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 SNORA20.1-201ENST00000364790 130 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Y_RNA.562-201ENST00000384695 113 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU4-30P-201ENST00000410245 143 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 COTL1P1-201ENST00000422309 375 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 PTGES3P4-201ENST00000426243 356 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 Z98949.2-201ENST00000440996 144 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
PGGT1BP53609 LARP7P3-201ENST00000579888 337 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
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