Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC011195.1-201ENST00000578177 177 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 DAOA-AS1_2.1-201ENST00000614829 187 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL603839.4-201ENST00000624658 1005 ntBASIC0.05□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MIRLET7D-201ENST00000362263 87 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-545P-201ENST00000362681 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-793P-201ENST00000384233 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-1067P-201ENST00000384752 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC006366.1-201ENST00000422002 759 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC243964.1-201ENST00000441814 261 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 ZNF736P5Y-201ENST00000451173 805 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC108740.1-201ENST00000498629 225 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 HMGB1P29-201ENST00000505659 499 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL136537.1-201ENST00000508199 538 ntTSL 3 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC008752.3-201ENST00000588113 712 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AP002802.2-201ENST00000605877 235 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 PTPN22-203ENST00000460620 1794 ntTSL 1 (best) BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MIR578-201ENST00000384828 96 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC078809.1-201ENST00000427601 140 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC010975.2-201ENST00000427781 588 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 PPEF1-AS1-201ENST00000430641 430 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 snoU13.19-201ENST00000459148 104 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC027335.1-201ENST00000515377 543 ntTSL 4 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-948P-201ENST00000516374 107 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 LINC02464-201ENST00000552060 368 ntTSL 2 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC0.04□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.4
PTPRGP23470 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-224P-201ENST00000384055 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-43P-201ENST00000384302 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-417P-201ENST00000384712 107 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 SNORA75.2-201ENST00000391138 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 SNORA75.3-201ENST00000391231 150 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL513412.1-201ENST00000445708 553 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RPS3A-208ENST00000509736 576 ntTSL 2 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MIR5697-201ENST00000578045 78 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL513423.1-201ENST00000621695 132 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 U4.7-201ENST00000638126 106 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC0.03□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-511P-201ENST00000363496 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-923P-201ENST00000364753 107 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC244098.3-201ENST00000424803 96 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC112206.4-201ENST00000515142 405 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-1110P-201ENST00000516462 101 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 SNORA31.10-201ENST00000516482 106 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU1-142P-201ENST00000516682 145 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MIR5692A1-201ENST00000580523 69 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MTATP6P2-201ENST00000603319 678 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-88P-201ENST00000606801 100 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC245297.2-201ENST00000610119 565 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MIR371B-201ENST00000638082 66 ntBASIC0.02□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 MIR1253-201ENST00000408273 105 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL353747.2-201ENST00000439207 205 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RPL23AP54-201ENST00000495129 419 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 VCAN-AS1-201ENST00000512090 424 ntTSL 3 BASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 RNU6-377P-201ENST00000515965 102 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL596327.1-201ENST00000603629 213 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 AL136317.1-201ENST00000612653 226 ntBASIC0.01□□□□□ -2.41
PTPRGP23470 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 346.8 ms