Protein–RNA interactions for Protein: O43310

CTIF, CBP80/20-dependent translation initiation factor, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 598 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTIFO43310 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC004817.2-201ENST00000561794 651 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 PWRN1-209ENST00000568019 359 ntTSL 3 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 VN1R91P-201ENST00000594377 169 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC006006.1-201ENST00000603082 144 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL021879.1-201ENST00000611756 288 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 U2.1-201ENST00000618978 145 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SMARCAD1-206ENST00000509418 2348 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.76□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 EYS-211ENST00000503581 10589 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORA80A-201ENST00000363922 136 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.380-201ENST00000365663 111 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC144568.1-201ENST00000520139 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL078605.1-201ENST00000603529 500 ntBASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CHD1-201ENST00000284049 6457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.75□□□□□ -1.97
CTIFO43310 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNA5SP126-201ENST00000365092 109 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR1302-3-201ENST00000408128 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL138962.1-201ENST00000417987 411 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNA5SP367-201ENST00000516557 118 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.74□□□□□ -1.97
CTIFO43310 OGN-201ENST00000262551 2971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.401-201ENST00000383965 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPL21P1-201ENST00000399532 476 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC107083.1-201ENST00000439643 279 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC026241.1-201ENST00000517873 2142 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 IGLV3-17-201ENST00000519099 244 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC040936.1-201ENST00000534543 172 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MYL12BP1-201ENST00000569826 507 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RAC1P9-201ENST00000604990 392 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR7106-201ENST00000612419 65 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 NPPA-AS1_3.1-201ENST00000617059 108 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 HS1BP3-208ENST00000631166 78 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 HMHB1-202ENST00000638299 126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AC138915.1-201ENST00000565427 1685 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 Y_RNA.26-201ENST00000362539 101 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CTIFO43310 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
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