Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

Predictions only

Length 582 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 AC140059.1-201ENST00000489238 361 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC018904.1-201ENST00000560594 542 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC125232.2-201ENST00000592457 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AL138963.2-201ENST00000605137 226 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MS4A14-202ENST00000395001 3401 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.512-201ENST00000384518 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-159P-201ENST00000391080 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 LINC01509-202ENST00000423523 408 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Z96811.1-201ENST00000445880 108 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC073901.1-201ENST00000462471 408 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC108516.1-201ENST00000503666 257 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SCARNA13-201ENST00000516672 275 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MIR2355-201ENST00000517199 87 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 COX6CP5-201ENST00000527162 228 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC090398.1-202ENST00000580403 457 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF861P-201ENST00000588126 639 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC005296.1-201ENST00000616145 209 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 ZNF204P-201ENST00000416749 2397 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 FAM46D-201ENST00000308293 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.47-201ENST00000362697 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.551-201ENST00000384661 102 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MIR218-1-201ENST00000384999 110 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 TRAV34-201ENST00000390461 349 ntAPPRIS P1 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-130P-201ENST00000411112 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RNU6-1001P-201ENST00000411265 100 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 Z92545.1-201ENST00000411782 234 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MTCYBP9-201ENST00000431021 303 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 IFT74-AS1-201ENST00000456198 405 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 SEM1P1-201ENST00000506694 209 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC034114.1-201ENST00000520293 285 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC010620.2-201ENST00000600135 313 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 AC011476.5-201ENST00000615594 130 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
SHOC2Q9UQ13 TCF12-203ENST00000343827 3956 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.149-201ENST00000363558 117 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 SET-203ENST00000372688 801 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNU6-926P-201ENST00000384075 107 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RPL30P4-201ENST00000429309 333 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC091826.1-201ENST00000514065 313 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 MIR3199-1-201ENST00000582434 88 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 7SK.10-201ENST00000621414 298 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 MCF2-208ENST00000519895 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNU1-72P-201ENST00000362976 153 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.152-201ENST00000363578 100 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.176-201ENST00000363815 109 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 SNORA68.1-201ENST00000364537 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 SNORA63.7-201ENST00000365579 123 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
SHOC2Q9UQ13 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
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