Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD4

BRPF3, Bromodomain and PHD finger-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,205 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRPF3Q9ULD4 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP383-201ENST00000362934 120 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU6ATAC40P-201ENST00000408580 137 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC112771.1-201ENST00000463581 102 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNA5SP385-201ENST00000515947 110 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC004467.1-201ENST00000615678 330 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AP003355.3-201ENST00000623465 114 ntBASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SLC30A6-204ENST00000406369 4589 ntTSL 1 (best) BASIC4.1□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC104332.2-201ENST00000429959 156 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC104332.1-201ENST00000440471 797 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC069023.1-201ENST00000442231 221 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC146507.2-201ENST00000460608 476 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RN7SL75P-201ENST00000461926 281 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU1-143P-201ENST00000516296 146 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SNORA31.26-201ENST00000517250 137 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 MIR4282-201ENST00000583613 67 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 U1.23-201ENST00000610293 146 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 RNU1-68P-201ENST00000615382 146 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 U1.39-201ENST00000621562 146 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC018692.3-201ENST00000623929 123 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 AC091932.3-201ENST00000624223 323 ntBASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 WNK3-202ENST00000375159 5403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 NBEAL1-203ENST00000449802 10938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.09□□□□□ -1.75
BRPF3Q9ULD4 SPEF2-203ENST00000440995 5964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 USP9Y-201ENST00000338981 10036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1310P-201ENST00000384153 107 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU6-1289P-201ENST00000384431 106 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ANKRD30BP1-201ENST00000451052 2186 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SNORA84-201ENST00000459229 133 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU7-120P-201ENST00000459334 63 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC025518.1-201ENST00000479856 347 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 NR3C1-212ENST00000504572 3389 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
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BRPF3Q9ULD4 RNU2-27P-201ENST00000516185 142 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AP002392.1-201ENST00000537692 208 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC135050.6-201ENST00000610813 528 ntTSL 3 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 OR9G4-203ENST00000641581 2603 ntAPPRIS P1 BASIC4.08□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LUZP4-201ENST00000371920 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ABCC9-202ENST00000261201 4650 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SNORD17-201ENST00000390930 237 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 LINC02238-202ENST00000436262 320 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC068580.2-201ENST00000449749 338 ntTSL 5 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC008115.2-201ENST00000539988 241 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AC012254.1-201ENST00000592747 200 ntTSL 3 BASIC4.07□□□□□ -1.76
BRPF3Q9ULD4 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC4.07□□□□□ -1.76
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