Protein–RNA interactions for Protein: Q6R2W3

ZBED9, SCAN domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED9Q6R2W3 AC087260.1-201ENST00000546118 401 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TRAV32-201ENST00000553993 340 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC022166.2-201ENST00000566030 536 ntTSL 4 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC022960.1-201ENST00000582269 348 ntTSL 3 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC010620.1-201ENST00000601088 1102 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 DCAF17-212ENST00000611110 975 ntTSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RMST_2.1-201ENST00000617263 136 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 KTN1-205ENST00000395314 4618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.14□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 GLMN-201ENST00000370360 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORD114-2-201ENST00000363953 78 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.504-201ENST00000384481 104 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MIR618-201ENST00000385287 98 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNA5SP219-201ENST00000390940 113 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 DEFB108C-201ENST00000400154 252 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MTCO2P19-201ENST00000427513 598 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TOMM22P2-201ENST00000430735 237 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC073415.1-201ENST00000449240 153 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNVU1-2-201ENST00000516326 135 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-113P-201ENST00000516653 101 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL137161.1-201ENST00000532231 390 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC026470.3-201ENST00000563994 438 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC099850.3-201ENST00000577678 321 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC097520.1-201ENST00000624435 385 ntBASIC1.13□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 CEP162-202ENST00000403245 5156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.1-201ENST00000352915 104 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.466-201ENST00000384294 113 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-517P-201ENST00000384362 110 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL606923.1-201ENST00000406616 190 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC011243.1-201ENST00000420184 415 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU7-167P-201ENST00000459160 62 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU7-180P-201ENST00000459240 63 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 GMFBP1-201ENST00000467831 427 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC010493.1-201ENST00000513479 292 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MIR3973-201ENST00000579824 107 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC004223.2-201ENST00000590309 544 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC078795.3-201ENST00000602913 472 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 uc_338.34-201ENST00000617467 174 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC1.12□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SLC25A46-204ENST00000504098 2345 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MIR520E-201ENST00000384867 87 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL663109.1-201ENST00000411498 844 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL158828.1-201ENST00000438582 197 ntTSL 5 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC013470.1-201ENST00000453438 462 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AL163973.1-201ENST00000484753 577 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC117394.2-201ENST00000487827 323 ntTSL 3 BASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 RNU6-351P-201ENST00000516097 100 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MTND4P7-201ENST00000523876 130 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AP005136.1-201ENST00000579765 429 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC018889.1-201ENST00000605372 397 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 AC109347.2-201ENST00000610220 349 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 DLEU2_1.1-201ENST00000612089 120 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
ZBED9Q6R2W3 HULC.1-201ENST00000612720 240 ntBASIC1.11□□□□□ -2.23
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