Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 RNU6-743P-201ENST00000364151 106 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-57P-201ENST00000411348 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL353705.1-201ENST00000433468 480 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 UBBP3-201ENST00000445497 241 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC006435.5-201ENST00000624486 112 ntBASIC4.69□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 XIRP2-204ENST00000409273 12269 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 XRCC4-203ENST00000396027 1530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 PDE1A-205ENST00000435564 4885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 LINC00375-201ENST00000433074 601 ntTSL 5 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP46-201ENST00000438548 490 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC018868.1-201ENST00000491307 315 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 LINC02149-201ENST00000511443 558 ntTSL 1 (best) BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-191P-201ENST00000516295 94 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU7-143P-201ENST00000516781 65 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC090138.1-201ENST00000524493 578 ntTSL 4 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC009803.1-201ENST00000551531 416 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR4286-201ENST00000580651 93 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 DEFB117-201ENST00000602356 141 ntBASIC4.68□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU4-80P-201ENST00000363200 141 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 SNORD56.5-201ENST00000364281 72 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-338P-201ENST00000383888 105 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC010154.1-201ENST00000425857 269 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RPL29-203ENST00000475248 551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.700-201ENST00000516806 100 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR3158-1-201ENST00000583596 81 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC009779.6-201ENST00000603972 165 ntBASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 KIAA1107-203ENST00000637221 4337 ntTSL 1 (best) BASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 CACNB4-228ENST00000636598 7808 ntTSL 5 BASIC4.67□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 IBTK-209ENST00000510291 4109 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 KIAA1524-206ENST00000491772 3877 ntTSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.82-201ENST00000363000 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.92-201ENST00000363043 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.235-201ENST00000364412 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.306-201ENST00000365015 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.312-201ENST00000365089 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.322-201ENST00000365151 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC097662.1-205ENST00000433324 241 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL359853.2-201ENST00000442108 353 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL139109.1-201ENST00000455491 297 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.650-201ENST00000459002 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC025445.1-201ENST00000502728 300 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 SNORA67.7-201ENST00000516664 135 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.777-201ENST00000516982 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 PRELID2P1-201ENST00000552837 301 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.771-201ENST00000598668 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC027045.1-201ENST00000609065 202 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.789-201ENST00000622480 102 ntBASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 BCLAF1-205ENST00000527536 5371 ntTSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 DDIAS-201ENST00000329143 3367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 KTN1-203ENST00000395309 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 PRRG1-202ENST00000449135 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.66□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MGAT4C-210ENST00000620241 3194 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.65-201ENST00000362846 100 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP283-201ENST00000365604 119 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RPL29P14-201ENST00000495837 428 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 CENPJ-205ENST00000545981 4299 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 GCSAML-203ENST00000366491 4130 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 SYNE2-202ENST00000344113 21777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 FNDC3A-202ENST00000398316 5714 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 FAM184A-202ENST00000352896 3700 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR372-201ENST00000362225 67 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-740P-201ENST00000364734 105 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MIR873-201ENST00000401120 77 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.590-201ENST00000410140 107 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU2-61P-201ENST00000411069 191 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 COX6CP14-201ENST00000469580 174 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RN7SL691P-201ENST00000494487 301 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RNU6-56P-201ENST00000516986 93 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
TPRNQ4KMQ1 AC073346.2-201ENST00000624724 2058 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
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