Protein–RNA interactions for Protein: Q3SY56

SP6, Transcription factor Sp6, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP6Q3SY56 snoU13.9-201ENST00000458927 103 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNA5SP458-201ENST00000516188 119 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RMST_3.1-201ENST00000611651 109 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL353997.5-201ENST00000618886 171 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC095038.3-201ENST00000634439 195 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR3974-201ENST00000637126 96 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.08□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-414P-201ENST00000363705 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-82P-201ENST00000363970 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-296P-201ENST00000384608 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR150-201ENST00000385048 84 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR548B-201ENST00000385247 97 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-780P-201ENST00000391030 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC015922.2-201ENST00000435593 184 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 UBE2V1P8-201ENST00000437166 265 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 PLCB1-IT1-201ENST00000441231 373 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MAMDC2-AS1-205ENST00000451488 317 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORD13-201ENST00000459299 104 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC098862.1-201ENST00000504991 413 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC108078.1-201ENST00000508073 725 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNA5SP437-201ENST00000517249 129 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC026407.1-201ENST00000518369 204 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC023200.1-201ENST00000519660 651 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC090821.2-201ENST00000523552 176 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC007495.2-202ENST00000564102 535 ntTSL 4 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR4422-201ENST00000581938 83 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AP001109.1-201ENST00000587114 279 ntTSL 3 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 PRR13P7-201ENST00000605538 430 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC083806.3-201ENST00000614016 455 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC1.07□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-562P-201ENST00000362731 107 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 Y_RNA.67-201ENST00000362870 100 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA33-201ENST00000363664 130 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU4-66P-201ENST00000365199 138 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR520A-201ENST00000384862 85 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-360P-201ENST00000390944 104 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORD37.1-201ENST00000390968 65 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CDK8P2-201ENST00000415020 547 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 FTH1P12-201ENST00000432137 551 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 TRAPPC2P8-201ENST00000440676 396 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL360091.2-201ENST00000446847 650 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ATP5J2P3-201ENST00000451550 258 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC010486.3-201ENST00000511602 785 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-189P-201ENST00000516120 101 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AP003034.1-201ENST00000534621 422 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC026765.1-201ENST00000547876 435 ntTSL 3 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 CR936218.1-201ENST00000570454 304 ntTSL 2 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 MIR3611-201ENST00000584484 83 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC069114.2-201ENST00000604699 304 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 PLD1-217ENST00000627725 174 ntTSL 5 BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 BRCA1-202ENST00000354071 4497 ntTSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ZNF260-203ENST00000588993 4174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 ASPN-202ENST00000375544 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.06□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6-38P-201ENST00000384085 107 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
SP6Q3SY56 RNU6ATAC2P-201ENST00000387943 126 ntBASIC1.05□□□□□ -2.24
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