Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 GS1-279B7.1-204ENST00000641809 378 ntBASIC1.69□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-522P-201ENST00000364497 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC083904.1-201ENST00000487828 231 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR3618-201ENST00000580330 88 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 LINC02555-201ENST00000563933 1951 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 CBX3P1-201ENST00000325243 554 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNA5SP493-201ENST00000364115 91 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR450B-201ENST00000401182 78 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MTND3P9-201ENST00000429526 346 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC092436.3-201ENST00000511788 257 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL590240.4-201ENST00000616908 390 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 Y_RNA.38-201ENST00000362617 102 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-1317P-201ENST00000364582 104 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL030996.1-201ENST00000411430 235 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNRPG-202ENST00000413456 398 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL589823.1-201ENST00000429577 183 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SNRPG-205ENST00000449935 428 ntTSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AL160162.1-201ENST00000456715 442 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SCOCP1-201ENST00000554676 349 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC100830.2-201ENST00000581636 240 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 ATP11C-202ENST00000361648 6010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC1.65□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 SKIL-204ENST00000458537 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.14
CDKN3Q16667 MT-ND1-201ENST00000361390 956 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-933P-201ENST00000384424 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TRAJ21-201ENST00000390516 55 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Y_RNA.615-201ENST00000410769 117 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AP1B1P2-201ENST00000416196 106 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU1-131P-201ENST00000458943 161 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC079907.1-201ENST00000552707 374 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 MIR4713-201ENST00000582691 75 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 FAM157A-202ENST00000615155 405 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 PTP4A2-220ENST00000627328 615 ntTSL 5 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SYT14-201ENST00000367015 5094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.65□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-451P-201ENST00000362921 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNORA48.1-201ENST00000390879 135 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 DEFB110-202ENST00000393660 189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
CDKN3Q16667 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms