Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 RGPD4-201ENST00000408999 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LINC00907-209ENST00000593234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 U8.7-201ENST00000364940 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 Y_RNA.525-201ENST00000384570 113 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC092941.1-201ENST00000415940 427 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL117339.2-201ENST00000430475 180 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RNU7-197P-201ENST00000458836 62 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AC092991.1-201ENST00000477176 376 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 RN7SL600P-201ENST00000581811 299 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AKAP6-201ENST00000280979 15006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 LRRN3-203ENST00000422987 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 SYTL2-213ENST00000525702 2727 ntTSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 GABRG2-208ENST00000638552 3710 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 AL161457.2-203ENST00000590767 2663 ntTSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 PUS7L-207ENST00000551923 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 HERC4-204ENST00000395198 4445 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 TDRD1-202ENST00000369280 4062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.77
HIF1AQ16665 NDST4-201ENST00000264363 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MS4A14-208ENST00000531783 2910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 PLS1-201ENST00000337777 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ADGRL4-201ENST00000370742 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-1180P-201ENST00000364935 107 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 Y_RNA.521-201ENST00000384560 114 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNA5SP252-201ENST00000391131 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-588P-201ENST00000410281 105 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNA5SP38-201ENST00000410750 119 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 TBCAP1-201ENST00000436520 327 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AP002884.2-201ENST00000471647 395 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SRIP1-201ENST00000489235 288 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 TRBV12-2-201ENST00000489763 344 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RPL21P129-201ENST00000491732 478 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR449C-201ENST00000516047 92 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU2-56P-201ENST00000516826 190 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC130469.1-201ENST00000597256 388 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AD001527.1-201ENST00000604228 379 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR92B-201ENST00000607575 96 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR6844-201ENST00000637122 62 ntBASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 CCDC146-201ENST00000285871 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 BIRC3-201ENST00000263464 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 GAB1-203ENST00000505913 2477 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MARCH7-203ENST00000409591 2147 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RAPGEF6-210ENST00000512052 3535 ntTSL 2 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 BCL2L11-207ENST00000405953 425 ntTSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 Y_RNA.622-201ENST00000411091 108 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL356095.1-201ENST00000417217 199 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC090617.2-201ENST00000433167 404 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL162151.2-201ENST00000448875 158 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORA70.12-201ENST00000516084 153 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNA5SP179-201ENST00000517284 121 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC023632.4-201ENST00000517783 191 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 YPEL5P3-201ENST00000547227 352 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC091167.4-201ENST00000605079 184 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 TUG1_4.1-201ENST00000619464 181 ntBASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 BCL2L11-225ENST00000640419 249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 FZD3-201ENST00000240093 13736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 CEP170-215ENST00000481987 3031 ntTSL 5 BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 EVI5-201ENST00000370331 7403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.95□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ZBBX-201ENST00000307529 3071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RAP1GDS1-205ENST00000408927 3681 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNA5SP130-201ENST00000364431 114 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-728P-201ENST00000365375 104 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNORD116-13-201ENST00000384408 92 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 C1orf195-201ENST00000424792 255 ntTSL 2 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 SNRPGP5-201ENST00000456003 220 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC146944.2-203ENST00000502493 354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 LINC02276-201ENST00000508388 138 ntTSL 3 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC139495.1-202ENST00000513164 354 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC006130.2-201ENST00000586202 326 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AL137849.1-201ENST00000604767 169 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 AC090517.3-201ENST00000625170 141 ntBASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 DAZ4-202ENST00000382314 3910 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.94□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 DMXL1-201ENST00000311085 11072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RNU6-153P-201ENST00000364422 104 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 Y_RNA.361-201ENST00000365515 120 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 ZBTB37-201ENST00000367701 19128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 MIR199A2-201ENST00000385289 110 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 RPL21P65-201ENST00000406094 466 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
HIF1AQ16665 Z98742.2-201ENST00000431564 187 ntBASIC3.93□□□□□ -1.78
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