Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Length 540 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 DOCK7-201ENST00000251157 7084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC087521.2-201ENST00000499066 2190 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SLITRK4-203ENST00000596188 8545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SOS1-202ENST00000402219 8314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MCMDC2-207ENST00000492775 1831 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.71-201ENST00000362892 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-818P-201ENST00000364837 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-449P-201ENST00000383914 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-710P-201ENST00000410424 105 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AP003025.1-201ENST00000421650 149 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD2.1-201ENST00000458762 69 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC091153.1-201ENST00000466297 402 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AP001318.2-201ENST00000533378 492 ntTSL 3 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 LINC02253-201ENST00000559321 448 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR4444-1-201ENST00000581696 74 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR4444-2-201ENST00000584390 74 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC107294.3-201ENST00000609211 526 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC084757.4-201ENST00000616350 526 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 U4.6-201ENST00000621618 127 ntBASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 CYSLTR1-203ENST00000614798 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 GEN1-201ENST00000317402 9854 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MBD5-212ENST00000627651 5610 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 C2orf78-201ENST00000409561 3045 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 CSRNP3-202ENST00000342316 11684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 TJP1-204ENST00000400011 6764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MGA-201ENST00000219905 12042 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-834P-201ENST00000362367 110 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNA5SP267-201ENST00000364893 126 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD116-14-201ENST00000383894 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD116-17-201ENST00000383929 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD116-15-201ENST00000384445 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD116-19-201ENST00000384729 92 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR200C-201ENST00000384980 68 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 HMGN2P31-201ENST00000432430 273 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC106707.2-201ENST00000484182 374 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC016553.1-201ENST00000513283 249 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNA5SP272-201ENST00000516095 111 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU6-1333P-201ENST00000516162 93 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC010177.1-201ENST00000547819 366 ntTSL 3 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RPL21P9-201ENST00000556149 474 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RPL30P11-203ENST00000598995 310 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AL034408.1-202ENST00000636088 415 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 PREPL-206ENST00000409936 5212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AL049781.1-201ENST00000623195 3585 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SPAM1-206ENST00000460182 2154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 ELF1-201ENST00000239882 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 ZFYVE16-202ENST00000505560 6599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 DMD-201ENST00000288447 3856 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.101-201ENST00000363154 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 U3.8-201ENST00000363675 217 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.262-201ENST00000364641 102 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.415-201ENST00000384012 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNA5SP171-201ENST00000391071 115 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 EIF4EP4-201ENST00000424916 578 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC023669.2-201ENST00000436266 239 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 LINC02146-201ENST00000504244 509 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORD116-25-201ENST00000516517 92 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC026403.1-201ENST00000518938 295 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 TGIF1P1-201ENST00000558095 802 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC009127.3-201ENST00000570531 403 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
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ECM1Q16610 NEDD4-201ENST00000338963 7019 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SLITRK5-201ENST00000325089 21103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 FAM111A-207ENST00000531147 3996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 CENPF-201ENST00000366955 10307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 CRISPLD1-205ENST00000523524 2100 ntTSL 2 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 DDX60L-201ENST00000260184 6754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.308-201ENST00000365043 101 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 IGKV3D-7-201ENST00000443397 384 ntAPPRIS P1 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RBMY2UP-201ENST00000453474 324 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RPL31P41-201ENST00000477967 372 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RPS29P2-201ENST00000479278 136 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 SNORA70.14-201ENST00000516205 110 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 RNU1-117P-201ENST00000517041 158 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 AC009137.1-201ENST00000562790 260 ntTSL 3 BASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR4679-2-201ENST00000578358 77 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 Y_RNA.802-201ENST00000614892 130 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
ECM1Q16610 PPIP5K2-215ENST00000613674 4933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.96□□□□□ -1.77
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