Protein–RNA interactions for Protein: Q16518

RPE65, Retinoid isomerohydrolase, humanhuman

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Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPE65Q16518 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.252-201ENST00000364556 101 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1274P-201ENST00000384557 107 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR27B-201ENST00000385129 97 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU2-25P-201ENST00000411041 191 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL592435.1-201ENST00000416401 469 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC005534.2-201ENST00000431047 433 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC090096.1-201ENST00000489168 390 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNA5SP320-201ENST00000516263 124 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNU6-1153P-201ENST00000516760 105 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC091144.1-201ENST00000519573 138 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TEX41-243ENST00000614173 190 ntTSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 CFH-202ENST00000367429 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 SEL1L2-201ENST00000284951 2224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.48□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AASDH-207ENST00000513376 3241 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.112-201ENST00000363250 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 Y_RNA.605-201ENST00000410577 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MRPS18CP6-201ENST00000423587 223 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL354949.1-201ENST00000446438 170 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RPL23AP94-201ENST00000512518 302 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RNA5SP54-201ENST00000516951 92 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC023442.1-201ENST00000531247 422 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC023824.2-201ENST00000566185 400 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AC100778.1-201ENST00000583579 332 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 AL355297.2-201ENST00000604792 129 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 RPAP3-202ENST00000380650 2149 ntTSL 1 (best) BASIC2.47□□□□□ -2.01
RPE65Q16518 MAP4K3-205ENST00000437545 3924 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.364-201ENST00000365532 101 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA69.1-201ENST00000390904 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC109329.2-201ENST00000519658 482 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 U4.3-201ENST00000621047 82 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 WARS-244ENST00000627608 123 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.46□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CCPG1-203ENST00000442196 3453 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-1072P-201ENST00000384703 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
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RPE65Q16518 TRDJ3-201ENST00000390476 59 ntAPPRIS P1 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC003685.2-201ENST00000422795 395 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC018865.2-201ENST00000423631 129 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 LINC02064-201ENST00000506492 470 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL356055.1-201ENST00000602528 446 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORD115-8-201ENST00000363856 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORD115-38-201ENST00000365037 82 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 Y_RNA.358-201ENST00000365491 99 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR518C-201ENST00000384822 101 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR592-201ENST00000384959 97 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 SNORA12-201ENST00000391162 147 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MIR1294-201ENST00000408503 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 LINC01344-201ENST00000420760 261 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 MAGEA8-AS1-201ENST00000427671 476 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
RPE65Q16518 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
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