Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 Y_RNA.153-201ENST00000363615 91 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.389-201ENST00000383924 113 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-708P-201ENST00000384217 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-823P-201ENST00000391042 103 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL162411.1-201ENST00000413145 526 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 LINC00407-201ENST00000426509 295 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 CR769767.1-201ENST00000436337 346 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 IGHVII-62-1-201ENST00000519283 235 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC090510.1-201ENST00000567456 425 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL078596.1-201ENST00000624856 447 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SLC4A7-201ENST00000295736 7757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 EFR3A-202ENST00000519656 5247 ntTSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Z82209.1-201ENST00000422141 2135 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC003984.1-201ENST00000450977 4104 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU1-57P-201ENST00000384491 166 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 Y_RNA.557-201ENST00000384680 107 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 RNU6-1328P-201ENST00000410938 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AJ239322.2-201ENST00000421696 575 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL358176.2-201ENST00000425769 204 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 EHHADH-202ENST00000440662 656 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 MTATP8P1-201ENST00000467115 207 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC092490.2-202ENST00000544922 462 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC027288.2-201ENST00000553028 243 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC131274.4-201ENST00000577879 398 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AC124312.5-201ENST00000604451 268 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 PRKACB-204ENST00000370685 4481 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 CEP57-213ENST00000541150 2911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 PARPBP-203ENST00000392911 1916 ntTSL 5 BASIC2.72□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 SYTL2-230ENST00000634661 6672 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
CNGA3Q16281 FAM214A-201ENST00000261844 4217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1105P-201ENST00000384774 107 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR628-201ENST00000385229 95 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-101P-201ENST00000410323 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 HMGB3P2-201ENST00000411913 584 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC114482.1-201ENST00000418010 247 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 U8.20-201ENST00000459445 131 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC040926.1-201ENST00000530195 238 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Z75746.1-201ENST00000440243 2080 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AGTPBP1-205ENST00000376083 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 Y_RNA.133-201ENST00000363428 110 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-1210P-201ENST00000363775 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 DEFA7P-201ENST00000382676 285 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MIR548F4-201ENST00000408515 105 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 RNU2-52P-201ENST00000410680 190 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 MTND3P2-201ENST00000438452 342 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.7□□□□□ -1.98
CNGA3Q16281 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.7□□□□□ -1.98
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