Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 RNU6-907P-201ENST00000390924 102 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 UBE2V1P4-201ENST00000425374 344 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL365496.1-201ENST00000426885 215 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL627311.1-201ENST00000431514 115 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL136369.1-201ENST00000437825 244 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RPL36AP21-201ENST00000490372 323 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AKIRIN2P1-201ENST00000505898 352 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC008869.1-201ENST00000510938 442 ntTSL 2 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 MTCO2P24-201ENST00000515611 426 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 RNU6-570P-201ENST00000517051 105 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AL133279.1-202ENST00000556789 456 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC084882.1-201ENST00000561254 555 ntTSL 4 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 LRRC37A5P-203ENST00000580181 585 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 UCA1.1-201ENST00000620952 75 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 CDK1-209ENST00000614696 1884 ntTSL 5 BASIC2.47□□□□□ -2.01
CCDC6Q16204 SHOC2-201ENST00000265277 3691 ntTSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 LRRCC1-202ENST00000414626 4493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIRLET7G-201ENST00000362280 84 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.480-201ENST00000384364 102 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.574-201ENST00000384766 95 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-1140P-201ENST00000410517 106 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SNORD56-201ENST00000413522 71 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL714022.1-201ENST00000439897 151 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC011005.2-201ENST00000487324 359 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPL23AP49-201ENST00000492925 468 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPS27P26-201ENST00000494583 239 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC116655.1-201ENST00000508324 901 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR4781-201ENST00000585250 76 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC034238.1-213ENST00000611148 150 ntTSL 5 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC138305.3-201ENST00000624988 240 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC099654.7-201ENST00000635788 2127 ntBASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 OR51A7-202ENST00000641490 2186 ntAPPRIS P1 BASIC2.46□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 CEP44-203ENST00000426172 3037 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 COMMD6-201ENST00000355801 486 ntTSL 2 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-874P-201ENST00000362390 105 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU6-702P-201ENST00000364982 107 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.307-201ENST00000365022 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 BPY2DP-201ENST00000422208 265 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC098831.1-201ENST00000440661 216 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RN7SKP210-201ENST00000459176 261 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC098869.1-201ENST00000481627 292 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPL17P19-201ENST00000489069 552 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 VTRNA2-2P-201ENST00000516091 103 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MDM2-221ENST00000517852 393 ntTSL 1 (best) BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AP000942.3-201ENST00000603702 160 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 U4.1-201ENST00000620349 87 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL606534.2-204ENST00000635008 178 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC009975.1-201ENST00000634588 2698 ntTSL 5 BASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.45□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.39-201ENST00000362620 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.188-201ENST00000363952 111 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU4-42P-201ENST00000364738 142 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.355-201ENST00000365462 98 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Y_RNA.452-201ENST00000384202 108 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 RPL26P27-201ENST00000414397 437 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL356277.2-201ENST00000421318 441 ntTSL 2 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 ELOCP20-201ENST00000422460 345 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL356320.1-201ENST00000429616 163 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC004869.2-201ENST00000436501 229 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.44□□□□□ -2.02
CCDC6Q16204 AL161651.1-201ENST00000440882 223 ntBASIC2.44□□□□□ -2.02
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