Protein–RNA interactions for Protein: Q15223

NECTIN1, Nectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NECTIN1Q15223 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC099520.1-202ENST00000503650 777 ntTSL 3 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR3117-201ENST00000584034 78 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL080274.1-201ENST00000605565 220 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC080128.1-201ENST00000474389 1917 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-474P-201ENST00000384243 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR559-201ENST00000385188 96 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RPL22P13-201ENST00000493291 347 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC114801.2-201ENST00000503825 781 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LNX1-AS1-202ENST00000510785 550 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNA5SP112-201ENST00000515937 99 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SCARNA3-201ENST00000517097 143 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC080078.3-201ENST00000605407 463 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LINC00836-202ENST00000626230 1640 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RFESD-202ENST00000380005 2587 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MTND4P27-201ENST00000450813 1354 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 XIRP2-201ENST00000295237 5246 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-486P-201ENST00000363116 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.197-201ENST00000364004 102 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1141P-201ENST00000364520 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SNORA67.1-201ENST00000364749 141 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1040P-201ENST00000383974 107 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 TRAJ34-201ENST00000390503 58 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU2-23P-201ENST00000410545 195 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL445685.2-201ENST00000422551 342 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC124916.1-201ENST00000444020 547 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL138900.1-201ENST00000449345 399 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LINC01766-201ENST00000453968 362 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC063944.1-201ENST00000496943 295 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC010420.1-201ENST00000515077 509 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU4ATAC7P-201ENST00000516280 125 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AP000889.1-201ENST00000530968 660 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL136038.2-201ENST00000553983 283 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC007375.1-201ENST00000554513 578 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC020661.2-201ENST00000560114 134 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 uc_338.22-201ENST00000622722 187 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MT-ND4-201ENST00000361381 1378 ntAPPRIS P1 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1115P-201ENST00000362490 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 Y_RNA.463-201ENST00000384271 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 U6atac.2-201ENST00000408644 118 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RN7SKP61-201ENST00000410642 295 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 CYCSP48-201ENST00000417124 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL356010.2-201ENST00000422844 197 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AIMP1P2-201ENST00000425294 312 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL137792.2-201ENST00000443484 235 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 snoU13.14-201ENST00000459372 104 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 RNU6-1170P-201ENST00000515974 106 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AC109329.1-201ENST00000518744 317 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 DISC1FP1-204ENST00000563681 466 ntTSL 3 BASIC2.11□□□□□ -2.07
NECTIN1Q15223 MIR5701-3-201ENST00000578890 82 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
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