Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

Predictions only

Length 572 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA67.6-201ENST00000391093 99 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-373P-201ENST00000411247 98 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RN7SKP256-201ENST00000517201 314 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-85P-201ENST00000605989 107 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.68□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-336P-201ENST00000364891 107 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-53P-201ENST00000365367 106 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 TRAJ11-201ENST00000390526 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 HYDIN2-201ENST00000493714 554 ntTSL 4 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-358P-201ENST00000516564 75 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-1314P-201ENST00000517139 104 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC124290.1-202ENST00000523342 387 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL161670.1-201ENST00000554348 137 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR4299-201ENST00000577899 72 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA4-201ENST00000584302 138 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC012493.3-201ENST00000604494 112 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 ELOCP5-201ENST00000604924 333 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC1.67□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-254P-201ENST00000363377 107 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-827P-201ENST00000365553 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RPS29P13-201ENST00000402041 169 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL356432.1-201ENST00000405809 419 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RNU6-293P-201ENST00000411259 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC079150.1-201ENST00000413043 383 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL158823.1-201ENST00000418441 478 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 HMGN1P7-201ENST00000491722 313 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 MTCO2P30-201ENST00000503662 364 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC096733.1-201ENST00000503844 402 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 HMGB3P17-201ENST00000504195 649 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
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GPNMBQ14956 AC107953.1-201ENST00000522216 297 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 BNIP3P16-201ENST00000589779 534 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 AL357078.3-201ENST00000607528 618 ntBASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 HTN1-205ENST00000610341 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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GPNMBQ14956 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC1.66□□□□□ -2.14
GPNMBQ14956 CYSLTR1-201ENST00000373304 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.66□□□□□ -2.14
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GPNMBQ14956 LINC01938-201ENST00000521341 1864 ntTSL 2 BASIC1.65□□□□□ -2.14
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GPNMBQ14956 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-546P-201ENST00000383991 107 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.414-201ENST00000384011 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU1-123P-201ENST00000458950 160 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 AC092944.1-205ENST00000494885 517 ntTSL 4 BASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AK3P2-201ENST00000507976 429 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC087854.1-201ENST00000519706 414 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AF235103.2-201ENST00000525753 346 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC103996.1-201ENST00000555468 102 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC064836.2-201ENST00000609491 462 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AC100810.6-201ENST00000638068 285 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC1.65□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.64□□□□□ -2.15
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GPNMBQ14956 Y_RNA.86-201ENST00000363020 111 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-1329P-201ENST00000365664 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL033519.2-201ENST00000403958 392 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 AL356776.1-201ENST00000406574 447 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
GPNMBQ14956 RPS15AP10-201ENST00000432472 382 ntBASIC1.64□□□□□ -2.15
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