Protein–RNA interactions for Protein: Q14699

RFTN1, Raftlin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 578 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFTN1Q14699 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 HMGN1P13-201ENST00000505795 138 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 BMPR1B-AS1-201ENST00000510795 511 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC018554.1-202ENST00000565133 444 ntTSL 3 BASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC2□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 ST7-AS2-206ENST00000456577 1351 ntTSL 1 (best) BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR369-201ENST00000362155 70 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1159P-201ENST00000362933 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-434P-201ENST00000384376 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1222P-201ENST00000384615 107 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL591034.2-201ENST00000402839 359 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.646-201ENST00000410980 101 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC083867.1-201ENST00000413567 457 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC007314.1-201ENST00000414538 565 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC009161.1-201ENST00000417306 376 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL451060.1-203ENST00000431307 362 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 ODF2L-216ENST00000486215 311 ntTSL 2 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC096721.1-201ENST00000513540 552 ntTSL 4 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.670-201ENST00000516255 105 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1332P-201ENST00000516666 104 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNA5SP364-201ENST00000516938 78 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AP000763.2-201ENST00000540641 163 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC011611.2-201ENST00000549888 358 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC025423.5-201ENST00000550230 219 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC026462.3-202ENST00000564361 515 ntTSL 3 BASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC005034.5-201ENST00000604219 466 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 uc_338.20-201ENST00000621563 178 ntBASIC1.99□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SLC9C2-201ENST00000367714 4428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.40-201ENST00000362645 93 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.324-201ENST00000365165 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 TSACC-205ENST00000368255 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-306P-201ENST00000384617 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-310P-201ENST00000384655 107 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNY4P36-201ENST00000391116 96 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RFTN1Q14699 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RFTN1Q14699 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL118496.2-201ENST00000448300 230 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
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RFTN1Q14699 AC090568.2-205ENST00000518631 576 ntTSL 4 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AP003072.1-201ENST00000531740 145 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC008749.1-201ENST00000597650 306 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 U2.17-201ENST00000611454 95 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 DLEU2_5.1-201ENST00000615567 84 ntBASIC1.98□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 KTN1-207ENST00000438792 4449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.5-201ENST00000362334 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.395-201ENST00000383945 109 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.460-201ENST00000384255 102 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-1011P-201ENST00000384668 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-308P-201ENST00000390957 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORA75.4-201ENST00000391278 119 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 CBX3P6-201ENST00000430257 527 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MTCO1P29-201ENST00000496868 288 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 SNORA4.4-201ENST00000515921 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 RNU6-323P-201ENST00000521915 107 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC104576.1-201ENST00000524225 88 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC093913.1-201ENST00000614178 329 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
RFTN1Q14699 AC090574.1-201ENST00000623186 233 ntBASIC1.97□□□□□ -2.09
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