Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 ZNF117-204ENST00000620222 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.81□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SNORD114-19-201ENST00000363072 75 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-595P-201ENST00000363944 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-209P-201ENST00000384118 107 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.518-201ENST00000384552 113 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AL590004.2-201ENST00000404787 371 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC079354.2-201ENST00000453523 154 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC025465.3-201ENST00000510570 311 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC139720.2-201ENST00000514766 440 ntTSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC090124.1-201ENST00000525097 448 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 LINC02386-203ENST00000552182 501 ntTSL 3 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MIR4298-201ENST00000584380 73 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC073410.2-201ENST00000603240 332 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SCARNA15.3-201ENST00000626315 122 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SCARNA4.1-201ENST00000628597 123 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MIR6733-201ENST00000635723 61 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 FO624990.1-201ENST00000636373 85 ntBASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 C20orf24-208ENST00000639924 351 ntTSL 5 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 PIK3CA-201ENST00000263967 9093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.8□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 ZNF299P-201ENST00000406845 1804 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 CCDC66-201ENST00000326595 3027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.552-201ENST00000384665 112 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AL133475.1-201ENST00000404414 305 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.592-201ENST00000410274 109 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 LINC02046-202ENST00000481334 390 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC010469.2-201ENST00000496412 480 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU7-4P-201ENST00000516961 62 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 LINC02095-202ENST00000543512 323 ntTSL 3 BASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC141273.2-201ENST00000618989 130 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.79□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 ZNF334-205ENST00000615481 3706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 APCS-201ENST00000255040 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.123-201ENST00000363338 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU6-1083P-201ENST00000384022 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.471-201ENST00000384312 102 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 Y_RNA.539-201ENST00000384635 107 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RNU2-14P-201ENST00000411053 191 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC069079.1-201ENST00000419889 400 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AP001324.2-201ENST00000461163 319 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPL30P12-201ENST00000474666 353 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPL36AP48-201ENST00000485521 314 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC079600.2-201ENST00000550076 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MIR4513-201ENST00000581077 86 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC090897.2-201ENST00000581715 130 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 RPS15AP11-201ENST00000594193 385 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC009318.2-201ENST00000610917 651 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 DLEU2_2.2-201ENST00000615474 90 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AL138825.1-201ENST00000618587 192 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MTND5P6-201ENST00000422338 1798 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 TLK1-206ENST00000434911 2156 ntTSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.96
SEMA3AQ14563 AC002543.1-201ENST00000299783 1954 ntBASIC2.78□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 ZMYM1-210ENST00000611874 4466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.78□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SLC6A15-202ENST00000309283 3108 ntTSL 5 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 OR56A5-201ENST00000340110 738 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 snoU2_19.2-201ENST00000363024 80 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU1-138P-201ENST00000384093 164 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-622P-201ENST00000384272 103 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU4-70P-201ENST00000384579 139 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 U3.26-201ENST00000391236 204 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AL355388.1-201ENST00000415726 401 ntTSL 2 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC004383.1-201ENST00000438135 289 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 HMGB1P35-201ENST00000503360 598 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC004052.1-202ENST00000505680 516 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 AC109927.1-202ENST00000511951 282 ntTSL 3 BASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNU6-138P-201ENST00000515952 107 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 RNA5SP76-201ENST00000516277 87 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
SEMA3AQ14563 SNORA31.15-201ENST00000516771 132 ntBASIC2.77□□□□□ -1.97
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