| SEMA3A | Q14563 | ZNF117-204 | ENST00000620222 | 5317 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.81 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORD114-19-201 | ENST00000363072 | 75 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-595P-201 | ENST00000363944 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-209P-201 | ENST00000384118 | 107 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.518-201 | ENST00000384552 | 113 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TRAJ6-201 | ENST00000390531 | 62 nt | APPRIS P1 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNAP23-203 | ENST00000397138 | 477 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL590004.2-201 | ENST00000404787 | 371 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTCO3P29-201 | ENST00000432119 | 779 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPEP5-201 | ENST00000441137 | 268 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC00393-201 | ENST00000443621 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC079354.2-201 | ENST00000453523 | 154 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS29P27-201 | ENST00000463711 | 170 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC025465.3-201 | ENST00000510570 | 311 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC139720.2-201 | ENST00000514766 | 440 nt | TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1023P-201 | ENST00000516137 | 106 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | CKS1BP7-201 | ENST00000522230 | 235 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090124.1-201 | ENST00000525097 | 448 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | LINC02386-203 | ENST00000552182 | 501 nt | TSL 3 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4298-201 | ENST00000584380 | 73 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC073410.2-201 | ENST00000603240 | 332 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SCARNA15.3-201 | ENST00000626315 | 122 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | FO624990.1-201 | ENST00000636373 | 85 nt | BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | C20orf24-208 | ENST00000639924 | 351 nt | TSL 5 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | PIK3CA-201 | ENST00000263967 | 9093 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.8 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF299P-201 | ENST00000406845 | 1804 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | RNU6-142P-201 | ENST00000384019 | 107 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AL133475.1-201 | ENST00000404414 | 305 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.592-201 | ENST00000410274 | 109 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | AC007969.2-201 | ENST00000441891 | 191 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL39P29-201 | ENST00000447779 | 157 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | LINC02095-202 | ENST00000543512 | 323 nt | TSL 3 BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4446-201 | ENST00000578505 | 67 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP001282.2-201 | ENST00000616149 | 309 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC141273.2-201 | ENST00000618989 | 130 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SDR42E1P4-201 | ENST00000620894 | 481 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC130454.1-201 | ENST00000622948 | 401 nt | BASIC | 2.79 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZNF334-205 | ENST00000615481 | 3706 nt | APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | APCS-201 | ENST00000255040 | 926 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.123-201 | ENST00000363338 | 102 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-1083P-201 | ENST00000384022 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.471-201 | ENST00000384312 | 102 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | Y_RNA.539-201 | ENST00000384635 | 107 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR625-201 | ENST00000385047 | 85 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU2-14P-201 | ENST00000411053 | 191 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EIF1AXP1-201 | ENST00000419267 | 435 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC069079.1-201 | ENST00000419889 | 400 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL135938.1-201 | ENST00000443141 | 297 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP001324.2-201 | ENST00000461163 | 319 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL30P12-201 | ENST00000474666 | 353 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
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| SEMA3A | Q14563 | SCARNA17.1-201 | ENST00000516211 | 143 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SCARNA17.2-201 | ENST00000516334 | 143 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC079600.2-201 | ENST00000550076 | 130 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC007347.1-201 | ENST00000563879 | 281 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MIR4513-201 | ENST00000581077 | 86 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC090897.2-201 | ENST00000581715 | 130 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPS15AP11-201 | ENST00000594193 | 385 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC009318.2-201 | ENST00000610917 | 651 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SCARNA17.4-201 | ENST00000614296 | 143 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | DLEU2_2.2-201 | ENST00000615474 | 90 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL138825.1-201 | ENST00000618587 | 192 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND5P6-201 | ENST00000422338 | 1798 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | TLK1-206 | ENST00000434911 | 2156 nt | TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC002543.1-201 | ENST00000299783 | 1954 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | ZMYM1-210 | ENST00000611874 | 4466 nt | APPRIS P1 TSL 2 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | EYS-202 | ENST00000342421 | 2168 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SLC6A15-202 | ENST00000309283 | 3108 nt | TSL 5 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | OR56A5-201 | ENST00000340110 | 738 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | snoU2_19.2-201 | ENST00000363024 | 80 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU1-138P-201 | ENST00000384093 | 164 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-622P-201 | ENST00000384272 | 103 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU4-70P-201 | ENST00000384579 | 139 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | U3.26-201 | ENST00000391236 | 204 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AL355388.1-201 | ENST00000415726 | 401 nt | TSL 2 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004383.1-201 | ENST00000438135 | 289 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RPL39P38-201 | ENST00000467018 | 153 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AP001025.1-201 | ENST00000486139 | 332 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | HMGB1P35-201 | ENST00000503360 | 598 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC004052.1-202 | ENST00000505680 | 516 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | AC109927.1-202 | ENST00000511951 | 282 nt | TSL 3 BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNU6-138P-201 | ENST00000515952 | 107 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | RNA5SP76-201 | ENST00000516277 | 87 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
| SEMA3A | Q14563 | SNORA31.15-201 | ENST00000516771 | 132 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |