Protein–RNA interactions for Protein: Q13938

CAPS, Calcyphosin, humanhuman

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Length 189 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPSQ13938 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 Y_RNA.631-201ENST00000459607 101 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 SNORA25.11-201ENST00000515935 105 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 RNU1-41P-201ENST00000516161 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 RNU1-48P-201ENST00000516400 162 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 RNU6-699P-201ENST00000517081 110 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 RNU6-264P-201ENST00000517134 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 SNRPGP18-201ENST00000553000 214 ntBASIC2.53□□□□□ -2
CAPSQ13938 CEP57L1-223ENST00000523787 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 TXLNGY-201ENST00000253320 7299 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 U3.13-201ENST00000364804 214 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MIR548P-201ENST00000408336 84 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU4ATAC16P-201ENST00000408512 126 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 LINC01564-201ENST00000448327 566 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 LEKR1-205ENST00000477399 621 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 VCAN-AS1-202ENST00000513899 453 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC068992.1-202ENST00000519280 270 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 LINC02165-201ENST00000563061 443 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 XRCC4-202ENST00000338635 1579 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.445-201ENST00000384168 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.496-201ENST00000384444 101 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC007064.1-201ENST00000412238 351 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 PMCHL1-202ENST00000423102 261 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RPL39P40-201ENST00000445481 146 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU1-104P-201ENST00000517280 175 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC006504.5-204ENST00000592404 765 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL589935.1-202ENST00000612512 393 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 TTK-202ENST00000369798 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 STX7-202ENST00000367941 15791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.51□□□□□ -2.01
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CAPSQ13938 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 PRKD3-201ENST00000234179 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.31-201ENST00000362574 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNA5SP393-201ENST00000363423 117 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 SNORA25.6-201ENST00000364121 118 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CAPSQ13938 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CAPSQ13938 AC099799.1-201ENST00000439809 192 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC008154.1-201ENST00000453087 327 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL353752.1-201ENST00000454946 260 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC004917.1-201ENST00000490856 575 ntTSL 4 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 CKS1BP2-201ENST00000497342 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
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CAPSQ13938 Y_RNA.711-201ENST00000516993 102 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MIR3171-201ENST00000584270 74 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC092070.3-201ENST00000596041 337 ntTSL 3 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC020910.1-201ENST00000599404 413 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 VPS54-202ENST00000354504 3594 ntTSL 1 (best) BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.5□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 MIR6073-201ENST00000352083 89 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 RNU1-115P-201ENST00000365329 160 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
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CAPSQ13938 RNU2-63P-201ENST00000410792 194 ntBASIC2.49□□□□□ -2.01
CAPSQ13938 AC093423.2-201ENST00000429074 437 ntTSL 3 BASIC2.49□□□□□ -2.01
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