Protein–RNA interactions for Protein: Q13748

TUBA3C, Tubulin alpha-3C/D chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBA3CQ13748 LINC00933-203ENST00000559812 219 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC093831.2-201ENST00000624393 3427 ntBASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 FTX-214ENST00000638437 12267 ntTSL 5 BASIC3.15□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL356274.2-201ENST00000624379 3752 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LIG4-205ENST00000614526 3884 ntTSL 2 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 FTLP6-201ENST00000355274 422 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNA5SP197-201ENST00000363357 119 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.331-201ENST00000365267 102 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 U3.19-201ENST00000390893 196 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL139254.1-201ENST00000421114 376 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RN7SL499P-201ENST00000481141 276 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC104971.4-201ENST00000622763 249 ntTSL 5 BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ZNF479-202ENST00000331162 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 PROS1-203ENST00000407433 3335 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.14□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ZNF83-201ENST00000301096 2599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 DDX60L-207ENST00000505890 4568 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 FPGT-TNNI3K-202ENST00000370895 7566 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC008568.2-201ENST00000623862 2313 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.217-201ENST00000364214 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.435-201ENST00000384095 112 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL590383.1-201ENST00000428602 75 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 POLR2KP2-201ENST00000438155 177 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC110995.1-201ENST00000444185 628 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 DCLRE1CP1-201ENST00000454630 470 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL136164.1-201ENST00000456795 352 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.641-201ENST00000459414 105 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC103879.1-201ENST00000503093 255 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SCARNA20.6-201ENST00000517251 106 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC084365.1-201ENST00000552470 310 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MIR4276-201ENST00000584832 70 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC015911.6-201ENST00000588445 457 ntTSL 3 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC108706.1-201ENST00000611053 297 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ADARB1-213ENST00000611195 159 ntTSL 5 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC006001.4-201ENST00000622243 395 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC093908.1-201ENST00000623125 8092 ntBASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LINC01376-202ENST00000424895 1949 ntTSL 2 BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 CHD9-218ENST00000566029 13110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.13□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RBBP8P1-201ENST00000449447 1844 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Z83843.1-201ENST00000604070 3685 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 EFCAB3-202ENST00000450662 1694 ntTSL 5 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RXFP1-201ENST00000307765 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-50P-201ENST00000362356 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-778P-201ENST00000363269 103 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.230-201ENST00000364348 109 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.441-201ENST00000384123 112 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNORA46.1-201ENST00000391069 153 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6ATAC10P-201ENST00000408635 111 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AP000705.1-201ENST00000454567 350 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MAPK1-204ENST00000544786 951 ntTSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 LINC01570-201ENST00000561572 434 ntTSL 3 BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 MIR7112-201ENST00000616126 65 ntBASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 THNSL1-201ENST00000376356 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.12□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 ECT2-211ENST00000441497 2825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 HELLS-201ENST00000239026 2740 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 CLOCK-201ENST00000309964 10304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU6-653P-201ENST00000363074 106 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 CD24P4-201ENST00000382840 243 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL390729.2-201ENST00000416137 156 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC024067.1-201ENST00000426199 223 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AC010095.1-201ENST00000443543 144 ntBASIC3.11□□□□□ -1.91
TUBA3CQ13748 AL592309.2-201ENST00000444647 607 ntTSL 5 BASIC3.11□□□□□ -1.91
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