Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 AL391001.1-201ENST00000602747 715 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SUMO2P14-201ENST00000604488 293 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA80D-201ENST00000384488 135 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 snoU13.8-201ENST00000458890 104 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU7-159P-201ENST00000459284 62 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC145146.2-202ENST00000508118 326 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 CCDC7-209ENST00000539197 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC090049.2-201ENST00000550377 109 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 NAMPTP3-201ENST00000569273 224 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 ZRANB2-AS2-218ENST00000608360 722 ntTSL 5 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR8076-201ENST00000611401 83 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC107982.1-201ENST00000507171 1300 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 IL6ST-202ENST00000381286 201 ntTSL 1 (best) BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 TRAJ40-201ENST00000390497 61 ntAPPRIS P1 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL592310.1-201ENST00000414330 671 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO3P10-201ENST00000455912 772 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.674-201ENST00000516362 113 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 FAM92A-209ENST00000519679 538 ntTSL 4 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.778-201ENST00000620203 90 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 hsa-mir-3607.1-201ENST00000637229 79 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR653-201ENST00000385279 96 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 ZNF886P-201ENST00000450781 723 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RPL39P39-201ENST00000455840 151 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC245047.8-201ENST00000456455 284 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC026410.2-201ENST00000460281 156 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 LINC02358-201ENST00000514413 465 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC093303.1-201ENST00000514549 295 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-1278P-201ENST00000516130 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-416P-201ENST00000516265 103 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNHG14-219ENST00000553134 470 ntTSL 2 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC138869.1-201ENST00000568623 124 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-655P-201ENST00000362858 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-359P-201ENST00000365466 108 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC005019.2-201ENST00000434321 359 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND4P19-201ENST00000446659 478 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 EEF1E1P1-201ENST00000446998 430 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 CECR9-201ENST00000453421 199 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC091860.1-201ENST00000505723 432 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 PARPBP-209ENST00000537257 976 ntTSL 1 (best) BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL670729.3-201ENST00000602345 574 ntTSL 4 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC091912.2-201ENST00000624798 167 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP275-201ENST00000363936 118 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORA1.1-201ENST00000364671 133 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 TRAJ32-201ENST00000390505 66 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AL359634.1-202ENST00000404721 284 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND4P25-201ENST00000441039 533 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTATP6P30-201ENST00000443540 664 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC019155.3-201ENST00000454957 600 ntTSL 2 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 snoU13.30-201ENST00000458951 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SNORD4A-201ENST00000459174 72 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC113410.1-201ENST00000505029 247 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC127540.1-201ENST00000580311 689 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC005332.6-201ENST00000613178 446 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC136475.10-201ENST00000620253 385 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.99-201ENST00000363138 105 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP192-201ENST00000364404 120 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 Y_RNA.442-201ENST00000384131 102 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 CBX3P9-201ENST00000402326 552 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 LINC00397-201ENST00000422074 344 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCO1P57-201ENST00000432182 261 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC022364.2-201ENST00000457963 554 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTND1P22-201ENST00000510572 951 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC093206.1-201ENST00000515364 497 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC004148.1-201ENST00000571506 398 ntTSL 5 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 MTCYBP33-201ENST00000575007 1130 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC090615.1-201ENST00000577519 154 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 uc_338.36-201ENST00000622331 158 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AP000568.1-201ENST00000282964 442 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 SMIM11P1-201ENST00000369586 178 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 RNA5SP300-201ENST00000391197 107 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC068533.2-201ENST00000411872 306 ntBASIC-0.21□□□□□ -2.44
ATRQ13535 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC-0.21□□□□□ -2.44
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