Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 AL118523.1-201ENST00000444436 480 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC098820.1-201ENST00000453157 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL121594.1-201ENST00000475906 575 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MRPS36P2-201ENST00000512569 299 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC026462.2-201ENST00000565771 286 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 PRPSAP2-229ENST00000628609 192 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ANKAR-209ENST00000520309 4410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ARHGAP11A-207ENST00000565905 3318 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 THOC2-201ENST00000245838 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 CUL3-204ENST00000409777 3147 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
SP140Q13342 PIK3C2G-201ENST00000266497 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RICTOR-201ENST00000296782 7505 ntTSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL359854.1-201ENST00000614203 1594 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 CCDC178-213ENST00000583930 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 GYPA-201ENST00000324022 751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORD113-8-201ENST00000363497 74 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-1145P-201ENST00000384246 107 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNA5SP274-201ENST00000410484 108 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-1203P-201ENST00000410703 110 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 HMGN2P35-201ENST00000412164 270 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL359195.1-201ENST00000416657 339 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC121342.1-201ENST00000423914 550 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 LINC02336-201ENST00000434117 330 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPL39P38-201ENST00000467018 153 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPL23AP70-201ENST00000483361 460 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.680-201ENST00000516441 93 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MIR4765-201ENST00000585007 77 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SDR42E1P4-201ENST00000620894 481 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 GABRG2-229ENST00000641017 3628 ntBASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 PRKAA2-201ENST00000371244 9347 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.01□□□□□ -1.93
SP140Q13342 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 GNAI3-201ENST00000369851 27174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC073325.2-201ENST00000339545 159 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU5F-3P-201ENST00000363767 117 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.595-201ENST00000410403 105 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC097463.2-201ENST00000421074 142 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC145146.1-201ENST00000496370 254 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SCARNA17.1-201ENST00000516211 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SCARNA17.2-201ENST00000516334 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-794P-201ENST00000517261 64 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MIR3128-201ENST00000581957 66 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SCARNA17.4-201ENST00000614296 143 ntBASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 NBPF20-202ENST00000392971 18450 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SLCO1B3-201ENST00000261196 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL161431.1-201ENST00000618966 4205 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.179-201ENST00000363844 90 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC010731.3-201ENST00000415029 566 ntTSL 4 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC005002.2-201ENST00000438228 269 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL590422.1-201ENST00000451829 364 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORA40.9-201ENST00000515895 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.683-201ENST00000516508 93 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPPH1-2P-201ENST00000516688 293 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 DEFB108E-201ENST00000524692 240 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC023442.3-201ENST00000532199 495 ntTSL 2 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL683887.1-201ENST00000603401 287 ntTSL 3 BASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL670379.2-201ENST00000604983 252 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 ST7-AS1_1.1-201ENST00000611142 116 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AP001282.2-201ENST00000616149 309 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 MTND5P35-201ENST00000557537 1720 ntBASIC2.99□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.60-201ENST00000362831 98 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-961P-201ENST00000363893 105 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORA38.1-201ENST00000364172 131 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 Y_RNA.237-201ENST00000364439 102 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 SNORD67-201ENST00000390833 111 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPL21P3-201ENST00000395517 478 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RNU6-847P-201ENST00000411115 108 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPS3P1-201ENST00000456781 192 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC117462.1-201ENST00000461186 554 ntTSL 4 BASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPL7P49-201ENST00000471402 708 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RPL26P26-201ENST00000480251 434 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC006445.1-201ENST00000491925 405 ntBASIC2.98□□□□□ -1.93
SP140Q13342 AC111194.2-201ENST00000511222 455 ntTSL 5 BASIC2.98□□□□□ -1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.3 ms