Protein–RNA interactions for Protein: Q13286

CLN3, Battenin, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN3Q13286 AL606490.9-201ENST00000603331 271 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RDM1-221ENST00000617591 432 ntTSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 HOTTIP_4.1-201ENST00000618195 165 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SPTY2D1-AS1-205ENST00000635674 450 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC012442.3-202ENST00000636742 206 ntBASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AGTR1-204ENST00000418473 2071 ntTSL 5 BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ELAVL4-206ENST00000371827 3775 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.01□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 N4BP2L2-211ENST00000504114 2513 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ECT2-204ENST00000392692 4158 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 OR52E4-202ENST00000641726 2947 ntAPPRIS P1 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ATP8B4-201ENST00000284509 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 KYNU-201ENST00000264170 15316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 C12orf45-204ENST00000552951 23529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SNORA63.1-201ENST00000362493 131 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-198P-201ENST00000384258 104 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-750P-201ENST00000390946 107 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU2-70P-201ENST00000410718 179 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MTCO1P44-201ENST00000441935 243 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL031737.1-201ENST00000450125 223 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC010099.1-201ENST00000455434 375 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPS26P45-201ENST00000471748 340 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC010598.1-201ENST00000510378 103 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNA5SP73-201ENST00000516744 108 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ALG14-201ENST00000370205 9367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 BTAF1-204ENST00000544642 6938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC000403.1-201ENST00000613696 3585 ntBASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ZNF439-201ENST00000304030 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NR3C1-206ENST00000424646 4591 ntTSL 1 (best) BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SLAIN2-205ENST00000512093 4219 ntTSL 5 BASIC4□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NCOA1-201ENST00000288599 6952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CNGA1-201ENST00000358519 2627 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ABI3BP-206ENST00000471714 6783 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 GABRB2-203ENST00000393959 7191 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RGPD1-202ENST00000409776 6692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 TMEM38B-201ENST00000374688 3956 ntTSL 2 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CXADR-202ENST00000356275 270 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR450A1-201ENST00000362262 91 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 DYNLT3P1-201ENST00000378574 347 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU1-63P-201ENST00000383902 164 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR921-201ENST00000401133 56 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Y_RNA.617-201ENST00000410920 90 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Z74021.1-201ENST00000423610 407 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL500522.2-201ENST00000448562 343 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 HMGN2P16-201ENST00000456802 261 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SNORD65B-201ENST00000459126 73 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC080013.2-201ENST00000460866 323 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ATP6V1G1P6-201ENST00000504007 334 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNA5SP20-201ENST00000515976 84 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-63P-201ENST00000516690 95 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR4753-201ENST00000585119 83 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 snoZ196.1-201ENST00000625269 89 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 LINC01002-227ENST00000633363 541 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL672167.1-203ENST00000641299 2975 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MPDZ-215ENST00000541718 7603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PATJ-202ENST00000316485 3657 ntTSL 5 BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 EPC1-203ENST00000375110 3909 ntTSL 1 (best) BASIC3.99□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 ZNF345-214ENST00000612719 2938 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL161912.2-201ENST00000565707 3007 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 NFIB-210ENST00000543693 7622 ntTSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 BCLAF1-207ENST00000527759 4373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 CNTN6-201ENST00000350110 3814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU1-20P-201ENST00000363314 162 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR181A2-201ENST00000384863 110 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR548A1-201ENST00000385041 97 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 MIR300-201ENST00000401138 83 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC004552.1-201ENST00000419089 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC006028.1-201ENST00000438379 402 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PRSS3P4-201ENST00000453323 162 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL136097.2-201ENST00000457003 333 ntTSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 Y_RNA.649-201ENST00000459077 103 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPS26P3-201ENST00000470205 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC090543.2-201ENST00000483963 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC004057.1-201ENST00000485827 348 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC083906.5-201ENST00000503722 328 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNU6-781P-201ENST00000516377 101 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RNA5SP153-201ENST00000516498 76 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AL163973.3-201ENST00000547093 430 ntTSL 3 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC079598.5-201ENST00000547460 117 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 AC093732.2-201ENST00000607950 274 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RMST_8.1-201ENST00000610287 165 ntBASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 PPP1R9A-202ENST00000340694 9689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 SOS1-203ENST00000426016 8517 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC3.98□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 RGS18-201ENST00000367460 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.97□□□□□ -1.77
CLN3Q13286 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.97□□□□□ -1.77
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