Protein–RNA interactions for Protein: Q13099

IFT88, Intraflagellar transport protein 88 homolog, humanhuman

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT88Q13099 AC016700.2-201ENST00000446011 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNRPFP3-201ENST00000457792 225 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC015911.1-201ENST00000495111 156 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RPL39P5-202ENST00000512505 151 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC091047.1-201ENST00000533344 552 ntTSL 4 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MTND1P15-201ENST00000579262 949 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC073648.5-201ENST00000603502 305 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC012507.3-201ENST00000603556 477 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 NCRUPAR_2.1-201ENST00000616308 99 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 LINC02033-202ENST00000623312 492 ntTSL 3 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 ANKRD36-208ENST00000639751 3090 ntTSL 5 BASIC1.36□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 CYLC2-204ENST00000612124 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.36□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD116-9-201ENST00000384000 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU5A-6P-201ENST00000384136 116 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD116-3-201ENST00000384287 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD116-7-201ENST00000384404 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNORD116-5-201ENST00000384462 95 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC008440.2-201ENST00000413496 423 ntTSL 5 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AF124730.1-201ENST00000430001 327 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SNRPEP8-201ENST00000442866 260 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 RNU6-333P-201ENST00000459117 107 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC022447.4-201ENST00000504053 364 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC025030.2-201ENST00000552558 567 ntTSL 2 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 VN1R107P-201ENST00000601784 209 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL645939.4-201ENST00000604495 135 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AL050343.2-201ENST00000607338 280 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 AC017083.3-201ENST00000609955 700 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
IFT88Q13099 SPTSSB-205ENST00000620149 231 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 Y_RNA.409-201ENST00000383990 98 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.34□□□□□ -2.19
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IFT88Q13099 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 RNU4-55P-201ENST00000410731 137 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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IFT88Q13099 AC098826.2-201ENST00000452011 651 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RPL31P3-201ENST00000458430 332 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC007547.1-201ENST00000462177 490 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 PLCH1-AS2-201ENST00000472913 408 ntTSL 2 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC005741.1-201ENST00000511094 432 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RN7SKP298-201ENST00000515950 94 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 RNU6-835P-201ENST00000516974 104 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 IL7-206ENST00000520269 456 ntTSL 3 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MTND2P38-201ENST00000522536 667 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 AC104383.1-201ENST00000530297 370 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MDM2-233ENST00000545204 398 ntTSL 5 BASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR5094-201ENST00000578766 85 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
IFT88Q13099 MIR3136-201ENST00000583498 78 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
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