Protein–RNA interactions for Protein: Q12996

CSTF3, Cleavage stimulation factor subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSTF3Q12996 RNA5SP490-201ENST00000517141 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RPS3AP23-202ENST00000574601 686 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 ZNF667-AS1-209ENST00000601875 495 ntTSL 3 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 AL132765.2-201ENST00000610812 351 ntBASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 RTL4-201ENST00000340433 2613 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.04
CSTF3Q12996 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.28□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ZNF404-202ENST00000587539 1851 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.70-201ENST00000362886 110 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.356-201ENST00000365475 113 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.404-201ENST00000383978 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.490-201ENST00000384413 102 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL157709.1-201ENST00000412695 424 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPL23AP50-201ENST00000434149 455 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPL30P10-201ENST00000488148 337 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC026436.1-201ENST00000510537 270 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU7-175P-201ENST00000515915 61 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNA5SP384-201ENST00000516615 116 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6ATAC35P-201ENST00000609276 444 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Clostridiales-1.3-201ENST00000637703 147 ntBASIC2.27□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.263-201ENST00000364659 114 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU1-51P-201ENST00000365345 176 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1297P-201ENST00000384415 104 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR320B2-201ENST00000408479 138 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL353997.1-201ENST00000432936 108 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC096711.1-201ENST00000510967 347 ntTSL 5 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC010210.1-203ENST00000513905 260 ntTSL 3 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-277P-201ENST00000516272 106 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SCARNA16.2-201ENST00000516520 172 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC022035.1-201ENST00000579923 302 ntTSL 2 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORD53-201ENST00000579969 78 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR5690-201ENST00000583739 73 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC005899.2-201ENST00000584353 90 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC2.26□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 E2F5-208ENST00000521429 1551 ntTSL 5 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.319-201ENST00000365138 92 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.387-201ENST00000383918 102 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.405-201ENST00000383979 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.451-201ENST00000384200 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-1026P-201ENST00000384465 108 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.524-201ENST00000384564 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 Y_RNA.561-201ENST00000384694 100 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU6-541P-201ENST00000384709 110 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MTCO3P29-201ENST00000432119 779 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC245102.2-201ENST00000448956 180 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC234781.5-201ENST00000508429 271 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 APOOP3-201ENST00000536787 586 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 ANP32BP3-201ENST00000559213 706 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 SNRPGP20-201ENST00000604477 205 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC005014.2-201ENST00000607795 599 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AC023490.3-201ENST00000621762 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AL008636.1-201ENST00000625038 1018 ntBASIC2.25□□□□□ -2.05
CSTF3Q12996 AP000550.4-201ENST00000639507 358 ntTSL 3 BASIC2.25□□□□□ -2.05
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