Protein–RNA interactions for Protein: Q12986

NFX1, Transcriptional repressor NF-X1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFX1Q12986 PLCB1-233ENST00000637919 5074 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC016588.2-201ENST00000632484 3021 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 NEGR1-201ENST00000306821 5577 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ZC3H11A-214ENST00000639812 11825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 Y_RNA.111-201ENST00000363248 100 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNY4P6-201ENST00000363667 96 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-1264P-201ENST00000383891 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-484P-201ENST00000384016 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-418P-201ENST00000384035 107 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR670-201ENST00000390142 98 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 STON1-GTF2A1L-202ENST00000394754 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MS4A4E-202ENST00000398986 522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR891A-201ENST00000401237 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 CFAP100-207ENST00000510833 481 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA43.2-201ENST00000516652 128 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RGS5-206ENST00000527988 373 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC069240.1-201ENST00000548774 375 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR5685-201ENST00000579080 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR7151-201ENST00000617477 60 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC027309.3-201ENST00000623419 351 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 DMD-207ENST00000378677 13932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 N4BP2L2-201ENST00000267068 9427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 OR10J1-203ENST00000642080 3503 ntAPPRIS P1 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ADGRL2-208ENST00000370725 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 G2E3-201ENST00000206595 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PIGN-240ENST00000639912 6530 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 NOX4-202ENST00000343727 3347 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 OR8K3-203ENST00000641662 2438 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ACEA_U3.1-201ENST00000363057 217 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-727P-201ENST00000363592 107 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 TRAJ7-201ENST00000390530 59 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU2-37P-201ENST00000410695 177 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNRPEP9-201ENST00000436794 238 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 VWA8P1-201ENST00000510889 176 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR432-201ENST00000606207 94 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 uc_338.32-201ENST00000615087 172 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 5S_rRNA.11-201ENST00000618635 84 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 CLIC2-202ENST00000369449 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ZNF43-207ENST00000595461 3399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 GPRC6A-201ENST00000310357 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNF38-201ENST00000259605 5012 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ADGRG2-201ENST00000340581 3594 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC011266.1-201ENST00000624119 3569 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PLCL2-202ENST00000432376 3940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 EFHC1-205ENST00000538167 5308 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 DMXL2-202ENST00000449909 7465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 CCDC178-205ENST00000406524 3039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ZNF43-210ENST00000598381 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 STXBP4-201ENST00000376352 15590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA36A-201ENST00000384221 132 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR3074-201ENST00000384885 81 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PTMAP2-201ENST00000397627 327 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC092047.1-201ENST00000424997 240 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AF228730.3-201ENST00000436691 102 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 LINC01162-201ENST00000447262 447 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNRPGP3-201ENST00000469405 227 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RN7SKP57-201ENST00000517248 293 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC084364.2-201ENST00000546924 395 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC107016.1-201ENST00000550463 337 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SMAD5-AS1_1.1-201ENST00000619886 266 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 THEMIS-202ENST00000368250 4101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PTER-201ENST00000298942 3448 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MYNN-202ENST00000356716 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 NRIP1-201ENST00000318948 7556 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 HERC5-203ENST00000508159 2243 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MRPL42-206ENST00000549982 15582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RC3H2-203ENST00000373670 9248 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 N4BP2L2-205ENST00000446957 2071 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 EYS-202ENST00000342421 2168 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 LGI1-210ENST00000629035 2251 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC010733.2-201ENST00000589496 5702 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 LRFN5-204ENST00000554171 4253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA60-201ENST00000362396 134 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-140P-201ENST00000384566 108 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 Y_RNA.565-201ENST00000384719 101 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6ATAC-201ENST00000408749 126 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA36B-201ENST00000410438 131 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AL358232.1-201ENST00000448030 501 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ANP32BP2-201ENST00000454525 545 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RPL23AP67-201ENST00000465341 474 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNRPGP7-201ENST00000469016 106 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-1299P-201ENST00000516316 100 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 SNORA18.4-201ENST00000516440 124 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 RNU6-1282P-201ENST00000516735 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AF111169.4-202ENST00000553507 262 ntTSL 3 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AC025627.2-201ENST00000576220 160 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MIR6868-201ENST00000611215 58 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AL110115.1-201ENST00000614396 364 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 AL158835.3-201ENST00000625908 565 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 ZNF594-201ENST00000399604 4862 ntAPPRIS P1 BASIC4.47□□□□□ -1.69
NFX1Q12986 MYOT-201ENST00000239926 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
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