Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 RNU6-17P-201ENST00000384245 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-18P-201ENST00000384527 107 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR190B-201ENST00000401119 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL138827.1-201ENST00000402666 306 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 PLCL2-AS1-201ENST00000414844 311 ntTSL 2 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 EDDM3CP-201ENST00000415977 425 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RAB6C-AS1-202ENST00000433431 123 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RN7SL429P-201ENST00000479090 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RN7SL489P-201ENST00000486185 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RN7SL327P-201ENST00000488659 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 ANXA2P1-201ENST00000505539 926 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC004486.1-201ENST00000546846 233 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC004584.2-201ENST00000570407 410 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR4319-201ENST00000577285 85 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC090115.4-201ENST00000609970 188 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR6715A-201ENST00000615929 79 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC2.54□□□□□ -2
FOXO1Q12778 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 CACNB4-238ENST00000636901 7706 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 CHORDC1-205ENST00000529726 4805 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC062016.1-201ENST00000355719 319 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 Y_RNA.146-201ENST00000363549 102 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-280P-201ENST00000364145 104 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 USP9YP16-201ENST00000430287 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 USP9YP23-201ENST00000455085 407 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC105389.2-201ENST00000506475 435 ntTSL 3 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 SNORA25.14-201ENST00000516481 132 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 RNU6-58P-201ENST00000517143 103 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC022469.2-201ENST00000554759 396 ntTSL 5 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC135178.3-204ENST00000585181 451 ntTSL 2 BASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AC245060.5-201ENST00000610778 3293 ntBASIC2.53□□□□□ -2
FOXO1Q12778 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RGPD3-202ENST00000409886 5594 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNU6-99P-201ENST00000364721 107 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 TRAV41-201ENST00000390468 336 ntAPPRIS P1 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC063976.3-201ENST00000426849 329 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC011753.1-201ENST00000451001 220 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC008243.1-201ENST00000504955 389 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNU6-470P-201ENST00000515954 104 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC007598.1-202ENST00000561528 435 ntTSL 3 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR1244-1-201ENST00000612829 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC022202.1-201ENST00000613515 211 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 COMMD6-213ENST00000626103 120 ntTSL 5 BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR1244-3-201ENST00000635744 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR1244-2-201ENST00000636449 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR1244-4-202ENST00000636813 85 ntBASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 DYNC2H1-202ENST00000375735 13678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.52□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 Y_RNA.106-201ENST00000363189 100 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNU6-137P-201ENST00000363680 108 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 WARS2P1-201ENST00000429678 537 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MTND3P23-201ENST00000431980 347 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 SNORD109B-201ENST00000458961 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 SNORD109A-201ENST00000459128 67 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR2053-201ENST00000459295 91 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 HMGB3P3-201ENST00000510526 400 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AP000462.3-201ENST00000545593 330 ntTSL 5 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 LUZP6-201ENST00000589735 177 ntAPPRIS P1 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR203B-201ENST00000636080 86 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MTND5P16-201ENST00000460269 1703 ntBASIC2.51□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 MIR449A-201ENST00000362113 91 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
FOXO1Q12778 RNU4-79P-201ENST00000362764 141 ntBASIC2.5□□□□□ -2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 173.3 ms