Protein–RNA interactions for Protein: Q09028

RBBP4, Histone-binding protein RBBP4, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP4Q09028 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RPL23AP75-201ENST00000491601 451 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 PRDX4P1-201ENST00000507189 574 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC091976.1-202ENST00000509211 630 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNA5SP137-201ENST00000516833 135 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CERS6-AS1-202ENST00000594898 499 ntTSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 B3GNTL1P2-201ENST00000603673 288 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC098657.3-201ENST00000620434 263 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL591030.1-201ENST00000626131 627 ntTSL 3 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 DYNC2H1-203ENST00000398093 12945 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC1.87□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SIRT1-203ENST00000406900 3295 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CEP57L1-216ENST00000521522 2259 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RN7SKP223-201ENST00000410582 62 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SMG7-AS1-202ENST00000432837 466 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 TRBV25OR9-2-201ENST00000438417 374 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC096638.1-201ENST00000444678 216 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 LINC01203-202ENST00000456091 476 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC116337.1-201ENST00000509680 687 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORA20.3-201ENST00000516880 132 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC022306.2-201ENST00000617563 647 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ZEB2_AS1_1.1-201ENST00000621504 128 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC011124.2-201ENST00000518739 3222 ntTSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 CENPCP1-201ENST00000533085 2578 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Y_RNA.166-201ENST00000363730 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-596P-201ENST00000365395 98 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 HMGN2P39-201ENST00000398005 273 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 LINC01853-201ENST00000417715 444 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 EIF4EP2-201ENST00000422816 654 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL132875.2-201ENST00000436418 325 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 HMGB1P18-201ENST00000438801 619 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC116353.2-201ENST00000505332 712 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-991P-201ENST00000516168 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC008083.3-202ENST00000552063 277 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR4529-201ENST00000578110 78 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC091965.1-202ENST00000607662 397 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC013412.1-201ENST00000610687 192 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL359314.1-201ENST00000616913 261 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR219B-201ENST00000637023 88 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORD81.2-201ENST00000365153 76 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 Y_RNA.473-201ENST00000384333 102 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 HMGN2P18-201ENST00000450680 270 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 OR2AQ1P-201ENST00000451972 200 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC132942.1-201ENST00000486753 483 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC103851.1-201ENST00000506833 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AC026782.1-201ENST00000512952 449 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 RNU1-54P-201ENST00000517181 120 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC1.84□□□□□ -2.11
RBBP4Q09028 AP003174.2-201ENST00000544663 294 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.6 ms