Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 AC005178.1-201ENST00000508392 440 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 TRAPPC2P7-201ENST00000509650 231 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AP000755.2-201ENST00000526777 571 ntTSL 5 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AP003072.2-201ENST00000527756 676 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC064872.1-201ENST00000604823 1072 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC092354.1-201ENST00000606057 376 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC064807.4-201ENST00000607201 407 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AL136221.1-201ENST00000621449 509 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AL133216.2-202ENST00000634512 349 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR338-201ENST00000636369 67 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 BX322639.1-202ENST00000423987 2213 ntBASIC0.87□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AGR3-201ENST00000310398 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 LINC01312-201ENST00000412745 775 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MTND3P17-201ENST00000416968 344 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC090960.1-201ENST00000421072 306 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC009961.2-201ENST00000435771 251 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC099063.1-201ENST00000437128 324 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC008080.3-201ENST00000440074 380 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC099566.1-201ENST00000442558 479 ntTSL 3 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AGGF1P4-201ENST00000568249 801 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR3664-201ENST00000579074 99 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 BX284668.6-201ENST00000606899 438 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC006566.1-201ENST00000608943 513 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC068647.2-201ENST00000637380 353 ntBASIC0.86□□□□□ -2.27
TTPAP49638 PDCL2-201ENST00000295645 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 SNORA25-201ENST00000384384 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 Y_RNA.560-201ENST00000384689 102 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 Z99497.1-201ENST00000421282 135 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AF127577.5-201ENST00000449746 446 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 SCARNA18-201ENST00000459004 134 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 RPL39P28-201ENST00000465655 155 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC010486.2-201ENST00000505572 483 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 AC096558.1-203ENST00000550516 574 ntTSL 3 BASIC0.85□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 AC027335.2-201ENST00000624030 375 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 AL391516.1-201ENST00000554380 2449 ntBASIC0.85□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR337-201ENST00000362281 93 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 snoU2-30.2-201ENST00000362805 70 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 LINC01813-201ENST00000451034 712 ntTSL 1 (best) BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 CBX3P8-201ENST00000532412 525 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 MIR3124-201ENST00000582636 67 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 FAM71BP1-201ENST00000604431 523 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AL022345.2-201ENST00000606307 135 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AC016597.2-201ENST00000613256 341 ntBASIC0.84□□□□□ -2.27
TTPAP49638 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC0.84□□□□□ -2.27
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TTPAP49638 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 RNU11-5P-201ENST00000391216 129 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
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TTPAP49638 AC025428.1-201ENST00000444137 403 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC106892.1-201ENST00000491608 406 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC079140.5-201ENST00000507882 310 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC109446.2-201ENST00000567872 497 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 CENPF-206ENST00000614578 528 ntTSL 5 BASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 uc_338.11-201ENST00000619132 160 ntBASIC0.83□□□□□ -2.28
TTPAP49638 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU6-1123P-201ENST00000362347 106 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 RNU1-124P-201ENST00000363861 145 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
TTPAP49638 HMGN1P12-201ENST00000499125 195 ntBASIC0.82□□□□□ -2.28
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