Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AC092628.1-201ENST00000436250 252 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 NAF1-205ENST00000509434 385 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC008700.1-202ENST00000513657 468 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNA5SP337-201ENST00000517007 109 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC008662.2-201ENST00000522426 389 ntTSL 5 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 LINC01493-203ENST00000534756 509 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC025887.1-201ENST00000578349 264 ntTSL 3 BASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL031281.1-201ENST00000604049 488 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL133173.2-201ENST00000614270 90 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC009159.2-201ENST00000617603 606 ntBASIC0.68□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 CCDC68-202ENST00000432185 4014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC010615.1-201ENST00000594254 1764 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORA24.1-201ENST00000384401 135 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MIR608-201ENST00000384820 100 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNA5SP467-201ENST00000391274 118 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 LINC02263-203ENST00000426240 515 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 CCDC39-AS1-201ENST00000495357 283 ntTSL 3 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORA31.4-201ENST00000516049 129 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SNORA77B-201ENST00000578179 125 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MIR3682-201ENST00000581338 84 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MTCO2P2-201ENST00000591258 225 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC245297.3-203ENST00000612135 405 ntTSL 5 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MIR2909-201ENST00000617113 69 ntBASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 HIF1A-204ENST00000539097 3956 ntTSL 1 (best) BASIC0.67□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-1214P-201ENST00000363650 109 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 Y_RNA.159-201ENST00000363674 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RN7SKP200-201ENST00000410564 320 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL355674.1-201ENST00000423681 648 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC245047.4-201ENST00000433189 144 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 MTATP6P16-201ENST00000434543 526 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL603839.2-201ENST00000437060 546 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL353614.1-201ENST00000445631 206 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 EPS15P1-201ENST00000448836 336 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 ANKRD62P1-PARP4P3-201ENST00000456726 1181 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 LINC00709-201ENST00000458168 494 ntTSL 2 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC114982.1-201ENST00000469402 321 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC067942.3-201ENST00000512025 362 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC069113.1-201ENST00000517763 267 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC109479.2-201ENST00000517842 174 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SUMO2P16-201ENST00000519475 264 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC022616.3-201ENST00000523940 148 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AL035425.2-201ENST00000563887 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AC073539.2-201ENST00000597113 165 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 AC105148.1-201ENST00000604961 409 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AF246928.1-201ENST00000623768 87 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC120349.3-201ENST00000624377 529 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 SEPT14P19-203ENST00000633205 211 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 Y_RNA.458-201ENST00000384240 102 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 RNU6-925P-201ENST00000384629 104 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 RNA5SP511-201ENST00000410487 115 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 HTR2A-AS1-201ENST00000430913 429 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AL512791.1-201ENST00000555853 300 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC091544.5-202ENST00000568297 374 ntTSL 3 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC007948.1-201ENST00000581632 242 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC090578.1-201ENST00000604955 591 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
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PTPRBP23467 CTHRC1P1-201ENST00000605383 469 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC138749.5-201ENST00000611461 208 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 7SK.8-201ENST00000612110 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 7SK.11-201ENST00000615477 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC012676.2-201ENST00000619258 186 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 7SK.13-201ENST00000622040 250 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 AC009161.2-201ENST00000624626 138 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 TTTY3B-201ENST00000631331 344 ntTSL 1 (best) BASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 OR5AK4P-201ENST00000635912 903 ntBASIC0.66□□□□□ -2.3
PTPRBP23467 Y_RNA.85-201ENST00000363014 111 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 RNU6-1097P-201ENST00000363586 107 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
PTPRBP23467 MTCYBP36-201ENST00000404146 440 ntBASIC0.65□□□□□ -2.31
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