Protein–RNA interactions for Protein: O94888

UBXN7, UBX domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 489 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN7O94888 MIR5695-201ENST00000579717 85 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC01482-203ENST00000589610 468 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC114316.2-202ENST00000502934 2957 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL355596.1-201ENST00000565399 3996 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 USP45-208ENST00000500704 5826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AKAP7-209ENST00000541650 2008 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 PRKACB-207ENST00000394838 4294 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-873P-201ENST00000363833 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-639P-201ENST00000384074 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.526-201ENST00000384572 110 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RPL21P75-201ENST00000396599 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RPL21P28-201ENST00000401418 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC244505.4-201ENST00000434905 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SSXP5-201ENST00000443473 287 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CHEK2P4-201ENST00000450340 246 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RPL21P39-201ENST00000463605 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC087190.1-201ENST00000484462 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC107032.1-201ENST00000485945 480 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC093591.1-201ENST00000491435 481 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RPL21P16-201ENST00000495531 483 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC006504.6-201ENST00000590142 199 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORD58B-201ENST00000607313 66 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC040896.1-201ENST00000613819 479 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL035425.3-201ENST00000564206 4996 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 CCDC148-202ENST00000409187 2523 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RMDN2-203ENST00000402091 1973 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.158-201ENST00000363651 101 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA9.2-201ENST00000365361 133 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 Y_RNA.424-201ENST00000384063 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU6-281P-201ENST00000384212 103 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR887-201ENST00000401258 79 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNA5SP344-201ENST00000411081 104 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU2-32P-201ENST00000411193 191 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL139281.1-201ENST00000422120 335 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC093083.1-201ENST00000438633 347 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC093852.1-201ENST00000503587 266 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AP003171.1-201ENST00000532770 266 ntTSL 2 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC022616.8-201ENST00000533569 253 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL442163.3-201ENST00000554110 156 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AC025271.3-201ENST00000563031 255 ntTSL 5 BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 MIR5188-201ENST00000583467 113 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AL033523.1-201ENST00000605153 153 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 U4atac.1-201ENST00000618345 95 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 AKAP9-202ENST00000358100 10309 ntTSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
UBXN7O94888 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 TMPRSS11A-201ENST00000334830 3054 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 TRDJ2-201ENST00000390475 54 ntAPPRIS P1 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC112492.4-201ENST00000456549 352 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RN7SKP43-201ENST00000516173 320 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 Y_RNA.721-201ENST00000517207 102 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC069133.1-201ENST00000522857 566 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC087664.2-201ENST00000522898 551 ntTSL 4 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC093023.1-201ENST00000547375 507 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 MIR5006-201ENST00000583027 110 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC010999.1-201ENST00000611856 324 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC099654.10-201ENST00000640395 161 ntBASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 TMEM232-201ENST00000455884 2501 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 IKZF2-213ENST00000457361 9350 ntTSL 5 BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC2.83□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC096644.4-201ENST00000563417 2912 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 WDR3-201ENST00000349139 9974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 ZNF72P-201ENST00000425869 1908 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC091812.1-201ENST00000432235 1948 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RNU1-62P-201ENST00000362599 164 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RNU1-23P-201ENST00000363361 144 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 SNORA5B-201ENST00000363786 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 SNORA51.4-201ENST00000364993 124 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 SNORD14.1-201ENST00000365609 90 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 Y_RNA.485-201ENST00000384395 102 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RNY3P4-201ENST00000384428 101 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 BMS1P22-201ENST00000414726 313 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AL731684.2-201ENST00000426839 333 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 ARL5AP4-201ENST00000430731 512 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC004386.2-201ENST00000441858 148 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC009237.7-201ENST00000447357 229 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 MTCO3P8-201ENST00000453691 755 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AL365295.1-201ENST00000454942 514 ntTSL 5 BASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 SNORA59A-201ENST00000459326 152 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 RN7SL633P-201ENST00000488974 297 ntBASIC2.82□□□□□ -1.96
UBXN7O94888 AC010255.2-201ENST00000505209 428 ntTSL 3 BASIC2.82□□□□□ -1.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 106.9 ms