Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3L3

SH3BP1, SH3 domain-binding protein 1, humanhuman

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Length 701 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1Q9Y3L3 ZGRF1-212ENST00000612287 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MBNL3-204ENST00000370853 2661 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.32□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MME-216ENST00000615825 5523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 FBXO11-201ENST00000402508 3844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LCORL-202ENST00000382224 4984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SLC30A6-202ENST00000357055 4758 ntTSL 2 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD32A-201ENST00000364805 84 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.297-201ENST00000364950 91 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD63-201ENST00000384262 68 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR153-2-201ENST00000385225 87 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-139P-201ENST00000391307 165 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL139156.1-201ENST00000412785 841 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPL23AP95-201ENST00000426806 265 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL442638.1-201ENST00000443359 237 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR1302-2HG-201ENST00000469289 535 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR2276-201ENST00000516886 89 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SCARNA24.2-201ENST00000516968 130 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01195-201ENST00000570118 451 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL356157.2-201ENST00000605122 111 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC004792.1-201ENST00000614523 137 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OXR1-215ENST00000531443 3599 ntTSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 CEP70-211ENST00000484888 1993 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.31□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 DOPEY1-203ENST00000369739 7743 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MAPK10-266ENST00000641066 6555 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MINDY3-202ENST00000378036 2452 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.180-201ENST00000363867 113 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.269-201ENST00000364685 89 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 DEFB119-202ENST00000376315 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-318P-201ENST00000384283 103 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR888-201ENST00000401186 77 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNA5SP229-201ENST00000410809 99 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC092427.1-202ENST00000430569 476 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL020994.3-201ENST00000449126 274 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC087477.1-201ENST00000465747 340 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AP000870.1-201ENST00000472927 406 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC137770.1-201ENST00000504620 530 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC02233-201ENST00000513718 358 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 CR383656.8-201ENST00000549046 145 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC118755.2-201ENST00000584676 212 ntTSL 3 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC011471.1-201ENST00000585766 187 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 uc_338.25-201ENST00000613756 156 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 HDX-201ENST00000297977 6200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 BCLAF1P1-201ENST00000505813 2752 ntBASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 PRKACB-201ENST00000370680 1914 ntTSL 1 (best) BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 KBTBD3-207ENST00000534815 3396 ntTSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MUM1L1-203ENST00000372552 3957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.3□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-884P-201ENST00000363889 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 Y_RNA.200-201ENST00000364018 102 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU1-100P-201ENST00000365255 165 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-102P-201ENST00000384485 104 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR548M-201ENST00000408260 86 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RPS15AP7-201ENST00000439294 405 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC007969.2-201ENST00000441891 191 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL136987.2-201ENST00000457321 684 ntTSL 3 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC097462.2-201ENST00000504623 481 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SERF1AP1-201ENST00000514575 187 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-1114P-201ENST00000516022 107 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-232ENST00000544561 213 ntTSL 5 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4446-201ENST00000578505 67 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC008739.2-201ENST00000597006 317 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 U2.14-201ENST00000615943 113 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC110079.1-202ENST00000635213 138 ntBASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 PHTF2-202ENST00000275575 4541 ntTSL 1 (best) BASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC3.29□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MDM2-206ENST00000350057 1401 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 HERC4-201ENST00000277817 4371 ntTSL 1 (best) BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 NEB-220ENST00000618972 26307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 SNORD56.1-201ENST00000362913 68 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-879P-201ENST00000364328 108 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-290P-201ENST00000365212 101 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 UBA52P6-201ENST00000399822 382 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 NDUFS5P4-201ENST00000412983 318 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL445305.1-201ENST00000432577 575 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL138752.1-201ENST00000452964 351 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 HSPE1P25-201ENST00000455484 251 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AP002992.1-202ENST00000530842 551 ntTSL 2 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL132819.1-201ENST00000555595 208 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 MIR4643-201ENST00000577473 78 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 AL512605.2-201ENST00000592972 256 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 LINC01533-205ENST00000593056 607 ntTSL 3 BASIC3.28□□□□□ -1.88
SH3BP1Q9Y3L3 CDKN2B-AS.1-201ENST00000617921 150 ntBASIC3.28□□□□□ -1.88
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