Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 MIR569-201ENST00000385228 96 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 U3.40-201ENST00000408706 208 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-257P-201ENST00000410238 98 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU2-49P-201ENST00000410666 184 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RN7SL504P-201ENST00000494496 287 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC005840.1-201ENST00000498412 377 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC025946.2-201ENST00000603398 234 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-91P-201ENST00000607774 107 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 Xist_exon1.1-201ENST00000618930 85 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AL160287.1-202ENST00000638113 454 ntTSL 5 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 AC007496.3-201ENST00000624987 3443 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 PTPN13-202ENST00000411767 8119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 MAPK10-253ENST00000641010 4072 ntBASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 PKN2-AS1-202ENST00000458097 3542 ntTSL 2 BASIC3.66□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 SLC9C1-205ENST00000487372 3979 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 FIGNL1-203ENST00000419119 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RRAS2-211ENST00000537760 2034 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.82
FOXQ1Q9C009 RNU6-275P-201ENST00000364910 107 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 Y_RNA.510-201ENST00000384511 114 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU6-381P-201ENST00000391259 108 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR1289-1-201ENST00000408836 144 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC245291.1-201ENST00000419501 328 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC245052.1-201ENST00000426213 410 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AL135790.2-201ENST00000437701 267 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC003988.1-201ENST00000447198 578 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AL441985.1-201ENST00000457727 251 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SRI-210ENST00000490437 570 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 LINC01965-204ENST00000545549 575 ntTSL 4 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC090877.1-201ENST00000561418 344 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR4325-201ENST00000583049 90 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 U91328.3-201ENST00000608931 354 ntTSL 3 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC002076.2-201ENST00000617362 122 ntBASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC008505.1-204ENST00000637363 2714 ntTSL 5 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MGAT4A-204ENST00000414521 3709 ntTSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MYCBP2-211ENST00000544440 14664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 DNAJC10-201ENST00000264065 20129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.65□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 EMSY-210ENST00000529032 6848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AC068700.1-201ENST00000565862 3754 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU6-1010P-201ENST00000362757 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNA5SP306-201ENST00000411087 107 ntBASIC3.64□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 PTP4A1-205ENST00000626021 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.64□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 ERBB4-203ENST00000402597 11699 ntTSL 1 (best) BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 AP000867.2-201ENST00000532468 320 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 BX546450.2-201ENST00000602419 435 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 TCL6_2.1-201ENST00000615162 119 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 IDE-202ENST00000371581 4480 ntTSL 2 BASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 ADGRG4-201ENST00000370652 9820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 AC010889.1-201ENST00000566193 2666 ntBASIC3.63□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 FAT3-204ENST00000525166 18699 ntTSL 5 BASIC3.63□□□□□ -1.83
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FOXQ1Q9C009 POSTN-202ENST00000379743 3196 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 NUDT12-201ENST00000230792 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MBNL1-220ENST00000493459 4205 ntTSL 1 (best) BASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU4-15P-201ENST00000362613 141 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU4-10P-201ENST00000364383 140 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 MIR147B-201ENST00000390185 80 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 RNU6-239P-201ENST00000390990 99 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
FOXQ1Q9C009 SNORA26.5-201ENST00000391215 123 ntBASIC3.62□□□□□ -1.83
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