Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 AC124657.1-201ENST00000527819 429 ntTSL 3 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 NACAP3-201ENST00000552100 481 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC020895.1-201ENST00000595362 272 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL442067.1-201ENST00000613261 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RN7SL853P-201ENST00000617250 223 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC2.74□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SCN1A-219ENST00000641575 12874 ntAPPRIS ALT1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC091564.4-201ENST00000533934 2194 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 DLEU2_6.3-201ENST00000340052 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP139-201ENST00000364340 117 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU1-112P-201ENST00000364401 164 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.257-201ENST00000364596 102 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-968P-201ENST00000384076 107 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR512-1-201ENST00000384913 84 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MIR9-1-201ENST00000385198 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 TRAJ6-201ENST00000390531 62 ntAPPRIS P1 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6ATAC23P-201ENST00000408448 123 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL160162.1-202ENST00000417654 244 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SDAD1P3-201ENST00000427380 333 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AL139260.1-202ENST00000456813 441 ntTSL 3 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 U8.22-201ENST00000459141 133 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU7-23P-201ENST00000459465 62 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RN7SL297P-201ENST00000483161 293 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MRPL42P6-201ENST00000486397 371 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPS29P20-201ENST00000489592 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 MTND1P19-201ENST00000511780 315 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-388P-201ENST00000517012 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU6-389P-201ENST00000517048 105 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AP005436.2-201ENST00000528458 252 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AP003733.2-201ENST00000529409 171 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 HSPE1P20-201ENST00000538133 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC112481.1-201ENST00000549669 901 ntTSL 2 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC021739.1-201ENST00000559631 174 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC090617.3-201ENST00000573670 475 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC005357.1-201ENST00000588399 301 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 DLEU2_6.2-201ENST00000620994 136 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 IGHVIII-44-202ENST00000636235 289 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 U6.92-201ENST00000636464 89 ntBASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 ARHGAP5-202ENST00000345122 9604 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LTN1-201ENST00000361371 7685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 OLFM3-206ENST00000536598 2801 ntTSL 5 BASIC2.73□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AP003122.5-201ENST00000527668 3766 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RBBP8-202ENST00000360790 2962 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 Y_RNA.14-201ENST00000362415 103 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU4-82P-201ENST00000362443 140 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP213-201ENST00000391031 106 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RNA5SP21-201ENST00000410917 96 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC01684-201ENST00000415182 2176 ntTSL 1 (best) BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC009296.1-201ENST00000443146 155 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AF186996.7-201ENST00000492781 209 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 LINC02269-201ENST00000509968 511 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC034223.1-201ENST00000511054 599 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 SNORA31.23-201ENST00000517219 133 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 IGHVII-53-1-201ENST00000519538 255 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 CERS3-AS1-201ENST00000560643 372 ntTSL 3 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC110491.1-201ENST00000562191 2010 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 AC023043.3-201ENST00000593113 385 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 RMST_6.1-201ENST00000611980 203 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 U6.104-201ENST00000637979 90 ntBASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 QSER1-204ENST00000527788 5052 ntTSL 2 BASIC2.72□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 PRKG2-206ENST00000545647 3852 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.97
ZNF548Q8NEK5 NOC3L-201ENST00000371361 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-843P-201ENST00000384454 104 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AP003170.3-201ENST00000399123 158 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU2-38P-201ENST00000410856 79 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC009310.1-201ENST00000414414 451 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RPL21P38-201ENST00000418090 167 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC007179.2-207ENST00000435557 556 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC00393-201ENST00000443621 282 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01032-201ENST00000451690 276 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AP001025.1-201ENST00000486139 332 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC092666.1-201ENST00000492054 573 ntTSL 4 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SAR1B-211ENST00000509937 455 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC008892.1-201ENST00000511861 384 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1023P-201ENST00000516137 106 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 RNU6-1012P-201ENST00000516606 109 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AL356133.2-201ENST00000521572 371 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CKS1BP7-201ENST00000522230 235 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 MIR5571-201ENST00000577998 113 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC024610.1-201ENST00000582685 323 ntTSL 3 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 HMGN2P15-201ENST00000585707 270 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC022335.1-204ENST00000590779 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 AC019159.1-201ENST00000605094 187 ntBASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LINC01002-202ENST00000631412 459 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 LMBRD1-201ENST00000370570 2099 ntTSL 1 (best) BASIC2.71□□□□□ -1.98
ZNF548Q8NEK5 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.71□□□□□ -1.98
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