Protein–RNA interactions for Protein: Q4KMQ1

TPRN, Taperin, humanhuman

Predictions only

Length 711 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRNQ4KMQ1 AL773545.4-201ENST00000637262 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL513478.4-201ENST00000641636 310 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNF17-201ENST00000255324 5119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC4.76□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 IQGAP2-202ENST00000379730 5442 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 PARP8-211ENST00000505554 3825 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 TTC21B-AS1-201ENST00000440322 2260 ntTSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 ADAM29-211ENST00000514159 3010 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SPRR2C-201ENST00000290702 219 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP125-201ENST00000364843 120 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.418-201ENST00000384029 102 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SNORA3C-201ENST00000408792 125 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 CYCSP19-201ENST00000411715 316 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 LINC02559-201ENST00000420391 188 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC008134.1-201ENST00000420943 193 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP3-201ENST00000453844 468 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP40-201ENST00000517211 242 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 IGKV2-38-201ENST00000517443 247 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC008056.1-201ENST00000553322 394 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 TTC6-201ENST00000267368 1681 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SKIL-203ENST00000426052 2757 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU6-324P-201ENST00000363957 106 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC010163.2-201ENST00000416341 381 ntTSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC123900.1-201ENST00000420390 96 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 MRPS10P1-201ENST00000448483 130 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP49-201ENST00000516450 115 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RN7SKP282-201ENST00000516824 299 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC113192.1-201ENST00000527270 321 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 MIR4429-201ENST00000580105 73 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC005828.6-201ENST00000606610 232 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL591424.2-201ENST00000617023 128 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 CCNT2-201ENST00000264157 6917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 GABRG2-210ENST00000638772 7669 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 POLR2B-201ENST00000314595 3748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 GRAMD1C-202ENST00000440446 3475 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 PHC3-215ENST00000495893 12666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNA5SP124-201ENST00000362739 110 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU1-14P-201ENST00000362759 152 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SNORD115-30-201ENST00000364117 82 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AP002088.1-201ENST00000382740 395 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SNORA11F-201ENST00000408237 128 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC017079.2-201ENST00000416102 485 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 LINC01349-201ENST00000416343 497 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 LINC02041-201ENST00000440726 246 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RPL23AP81-201ENST00000455252 467 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC091959.1-201ENST00000495857 238 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC069360.1-201ENST00000503469 431 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU6-436P-201ENST00000516171 114 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC090616.3-201ENST00000582184 217 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL162424.1-201ENST00000602325 221 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 U6.115-201ENST00000636045 103 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 MT-ND5-201ENST00000361567 1812 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC135776.4-201ENST00000624300 1904 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.275-201ENST00000364726 110 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL139095.1-201ENST00000404326 391 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 MIR1179-201ENST00000408703 91 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC009238.1-201ENST00000442165 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC104389.3-201ENST00000445629 235 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL357134.1-201ENST00000445848 426 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC009237.6-201ENST00000446969 424 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU6-111P-201ENST00000517179 105 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC103794.1-201ENST00000531763 197 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 MIR7702-201ENST00000621931 59 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RBMS2-209ENST00000639027 192 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AC018555.1-201ENST00000567548 1980 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 AL159152.1-201ENST00000635019 2587 ntBASIC4.71□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 USH2A-201ENST00000307340 18883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.65
TPRNQ4KMQ1 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.277-201ENST00000364754 102 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 SNORA25B-201ENST00000365507 128 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL031003.1-201ENST00000404229 172 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AP000235.1-201ENST00000424017 479 ntTSL 3 BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 TMEM132D-AS1-202ENST00000510001 293 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR8059-201ENST00000620427 81 ntBASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 KIF21A-203ENST00000541463 4866 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 BRCA2-206ENST00000544455 10984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 NAIP-205ENST00000508426 4153 ntTSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 WDR72-201ENST00000360509 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.71□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 PRKG1-205ENST00000401604 5922 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MACF1-201ENST00000289893 19141 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-271P-201ENST00000363858 105 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 SNORA62.3-201ENST00000365110 153 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 Y_RNA.329-201ENST00000365209 107 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 MIR554-201ENST00000384874 96 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AL121872.1-202ENST00000435867 308 ntTSL 5 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC006011.1-201ENST00000442758 349 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RPL31P61-201ENST00000496160 376 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-966P-201ENST00000516479 104 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 RNU6-667P-201ENST00000517186 102 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC010900.2-201ENST00000604508 210 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
TPRNQ4KMQ1 AC112484.5-201ENST00000624189 228 ntBASIC4.7□□□□□ -1.66
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