Protein–RNA interactions for Protein: Q16656

NRF1, Nuclear respiratory factor 1, humanhuman

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Length 503 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRF1Q16656 RPS29P27-201ENST00000463711 170 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC016632.1-201ENST00000503994 196 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-720P-201ENST00000516363 108 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AP002884.4-201ENST00000527589 594 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL627230.6-201ENST00000611129 280 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 FER-210ENST00000628534 558 ntTSL 5 BASIC1.56□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SEMG2-201ENST00000372769 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.3-201ENST00000362331 103 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNY3P3-201ENST00000363816 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.554-201ENST00000384672 102 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 SRIP3-201ENST00000413200 219 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RPL23AP36-201ENST00000413895 458 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MTND3P21-201ENST00000433774 331 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL359672.1-201ENST00000442302 409 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 LINC00971-201ENST00000482721 535 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC008628.2-201ENST00000502605 298 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC093259.1-201ENST00000509755 300 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC025465.4-201ENST00000513422 638 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.665-201ENST00000516177 98 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 ZNF436-AS1-205ENST00000518600 376 ntTSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC103853.2-201ENST00000519805 716 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 AC016957.1-201ENST00000534895 309 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 AP005530.1-201ENST00000572608 567 ntTSL 3 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 EIF1P4-201ENST00000572664 335 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 DISC2.1-201ENST00000612827 205 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 TBC1D31-206ENST00000518805 2201 ntTSL 2 BASIC1.55□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AL500522.1-201ENST00000423667 318 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC073325.1-201ENST00000443714 542 ntTSL 4 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC010457.1-201ENST00000510469 458 ntTSL 3 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 AL773524.1-201ENST00000614065 229 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC010722.1-201ENST00000622595 582 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
NRF1Q16656 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.54□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
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NRF1Q16656 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.52□□□□□ -2.17
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NRF1Q16656 MIR378A-201ENST00000362177 66 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.373-201ENST00000365600 103 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 Y_RNA.516-201ENST00000384541 124 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNU6-997P-201ENST00000384725 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR181A1-201ENST00000385026 110 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 MIR29C-201ENST00000385231 88 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 RNU6-1106P-201ENST00000390845 107 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
NRF1Q16656 SNORA40.19-201ENST00000390846 128 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
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