Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 DEFB131C-201ENST00000528817 165 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC021269.2-201ENST00000532318 330 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC02442-201ENST00000537732 343 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC002558.3-201ENST00000574021 401 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC006023.1-201ENST00000603944 259 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC016727.2-201ENST00000603988 621 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 UBE2E2-206ENST00000613545 282 ntTSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC137590.2-201ENST00000619709 240 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 AC005858.4-201ENST00000623191 700 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
SNAPC1Q16533 ZCCHC10-202ENST00000355372 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.09□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 KIF20B-202ENST00000371728 6419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC016717.2-201ENST00000609089 5141 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SNORA18.2-201ENST00000383865 132 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR548F5-201ENST00000408421 86 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR1283-2-201ENST00000408621 87 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RN7SKP32-201ENST00000410167 303 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-174P-201ENST00000410406 106 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC027124.2-201ENST00000428249 105 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL035666.1-201ENST00000446195 348 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SNORD5.1-201ENST00000458800 75 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC007215.1-201ENST00000464893 276 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU7-30P-201ENST00000516835 62 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU4ATAC17P-201ENST00000517272 120 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC022690.2-201ENST00000525673 589 ntTSL 3 BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC078899.2-201ENST00000595282 212 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SCN7A-201ENST00000409855 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.08□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-845P-201ENST00000362578 103 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU4-9P-201ENST00000364951 139 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Y_RNA.339-201ENST00000365325 102 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MRLN-201ENST00000414264 422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RPL21P111-201ENST00000418453 477 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 LANCL1-AS1-203ENST00000433296 864 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Z82188.1-201ENST00000436709 154 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU2-44P-201ENST00000516795 194 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL157688.1-201ENST00000555990 369 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 ACTG1P17-203ENST00000561222 537 ntTSL 3 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC026470.2-201ENST00000561492 181 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR5696-201ENST00000578474 85 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR4273-201ENST00000582824 84 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AP005057.1-201ENST00000583827 574 ntTSL 4 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC010928.2-201ENST00000588017 287 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC005562.2-201ENST00000618264 111 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR6766-201ENST00000622641 72 ntBASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 NCBP1-205ENST00000629069 249 ntTSL 5 BASIC2.07□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 CSNK1G3-202ENST00000360683 4047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.07□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 TANK-201ENST00000259075 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 ARHGAP15-202ENST00000409869 2968 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 PARPBP-201ENST00000327680 3014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 U8.10-201ENST00000384260 133 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-842P-201ENST00000384269 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-301P-201ENST00000384277 107 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 LINC01323-201ENST00000486767 576 ntTSL 3 BASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 RNA5SP24-201ENST00000516478 95 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
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SNAPC1Q16533 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC103810.6-201ENST00000606708 136 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR6852-201ENST00000621699 66 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 DUXAP9-208ENST00000622815 614 ntBASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC018692.1-202ENST00000623559 676 ntTSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 TAB2-205ENST00000538427 4240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.06□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 CGGBP1-202ENST00000398392 5298 ntAPPRIS P1 BASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 SNORD115-32-201ENST00000364079 82 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 Y_RNA.533-201ENST00000384596 114 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR32-201ENST00000384965 70 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 MIR487A-201ENST00000385009 80 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC243428.1-201ENST00000421099 264 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AC096920.1-201ENST00000423991 241 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 HMGN2P3-201ENST00000433603 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 RPS3AP52-201ENST00000435639 297 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 HMGN2P5-201ENST00000436882 273 ntBASIC2.05□□□□□ -2.08
SNAPC1Q16533 AL035258.1-201ENST00000439450 439 ntTSL 3 BASIC2.05□□□□□ -2.08
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