Protein–RNA interactions for Protein: Q15911

ZFHX3, Zinc finger homeobox protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 3,703 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZFHX3Q15911 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AC092325.1-201ENST00000566449 554 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 LINC02104-202ENST00000604954 599 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.43
ZFHX3Q15911 AL663023.1-201ENST00000412932 853 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RAC1P8-201ENST00000427086 527 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC108733.1-201ENST00000479244 705 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC023538.1-201ENST00000534576 736 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL353765.1-201ENST00000605514 183 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MIR103A2-201ENST00000362154 78 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-862P-201ENST00000362804 105 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC005920.2-201ENST00000509833 332 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC009269.4-201ENST00000557828 440 ntTSL 3 BASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL357312.1-201ENST00000603879 298 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC007363.1-201ENST00000604736 620 ntBASIC-0.16□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-331P-201ENST00000384724 107 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 SPINT5P-201ENST00000448174 155 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU7-59P-201ENST00000459101 61 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 PRELID3BP2-201ENST00000605362 201 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RMST_10.1-201ENST00000616309 154 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL049545.1-201ENST00000401856 572 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC093297.2-205ENST00000508123 572 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6ATAC33P-201ENST00000408647 126 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU4-63P-201ENST00000411313 118 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC013262.1-201ENST00000426710 252 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC012445.1-201ENST00000442831 607 ntTSL 3 BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MTND5P2-201ENST00000442927 1142 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNFT1P2-201ENST00000443064 757 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 snoU13.27-201ENST00000459278 104 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AHI1-212ENST00000528103 441 ntTSL 1 (best) BASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC008759.3-201ENST00000613300 508 ntBASIC-0.17□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNA5SP128-201ENST00000365305 116 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-922P-201ENST00000516753 99 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MIR4431-201ENST00000579990 94 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MIR548AZ-201ENST00000616567 95 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MTND4P5-201ENST00000435821 1374 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 SNORD116-20-201ENST00000384529 92 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 SNAP23-203ENST00000397138 477 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNA5SP390-201ENST00000410191 113 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 LINC02264-201ENST00000442020 576 ntTSL 3 BASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC115990.1-201ENST00000526957 301 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
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ZFHX3Q15911 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.18□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 NCOR1P1-201ENST00000478176 406 ntTSL 1 (best) BASIC-0.18□□□□□ -2.44
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ZFHX3Q15911 LINC01934-201ENST00000414750 391 ntTSL 3 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 ZFAND6P1-201ENST00000434138 605 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC084149.2-201ENST00000438443 797 ntTSL 5 BASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ZFHX3Q15911 RNA5SP504-201ENST00000410676 117 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC096531.1-201ENST00000419107 107 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC005094.1-201ENST00000440420 368 ntBASIC-0.19□□□□□ -2.44
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ZFHX3Q15911 SNORD114-5-201ENST00000362928 70 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MIR644A-201ENST00000385262 94 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC027644.1-201ENST00000419595 298 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 ABCC13-201ENST00000429114 611 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU6-863P-201ENST00000515989 104 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 SNHG6-202ENST00000520619 479 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC106038.2-201ENST00000520706 568 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 TPRKBP2-201ENST00000565969 475 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL136363.2-201ENST00000604173 851 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC132825.7-201ENST00000638744 335 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 Y_RNA.57-201ENST00000362806 113 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNA5SP264-201ENST00000363115 107 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 TRAJ41-201ENST00000390496 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL138737.1-202ENST00000418834 876 ntTSL 3 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC003071.1-201ENST00000451219 789 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 BX664727.1-201ENST00000416024 466 ntBASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
ZFHX3Q15911 AL359771.1-201ENST00000441809 379 ntTSL 5 BASIC-0.2□□□□□ -2.44
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