Protein–RNA interactions for Protein: Q15628

TRADD, Tumor necrosis factor receptor type 1-associated DEATH domain protein, humanhuman

Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRADDQ15628 SNORA44.1-201ENST00000517031 108 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 HSPE1P18-201ENST00000517602 280 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC109446.1-201ENST00000566172 220 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC090517.2-201ENST00000614966 680 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 EFCAB5-213ENST00000638539 168 ntTSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 TBL1XR1-208ENST00000430069 7948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC009541.1-201ENST00000438279 2662 ntBASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.86□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 Y_RNA.89-201ENST00000363031 102 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-23P-201ENST00000363283 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-234P-201ENST00000365229 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-26P-201ENST00000383985 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-214P-201ENST00000384130 107 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AL357139.1-201ENST00000407792 426 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MIR548F1-201ENST00000408667 84 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RN7SKP192-201ENST00000411291 327 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AL358234.1-201ENST00000421132 273 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC012306.1-201ENST00000423267 114 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 LINC02541-201ENST00000427157 327 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 FAR2P3-204ENST00000434661 444 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU7-187P-201ENST00000458985 68 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC108037.1-201ENST00000514103 423 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AP003465.1-201ENST00000520575 382 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 HMSD-204ENST00000526932 162 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 ZNF519P2-201ENST00000557032 169 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 CYP4A27P-201ENST00000567218 190 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 PTP4A1-204ENST00000578299 135 ntTSL 2 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MIR4648-201ENST00000580107 72 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 CALCRL-201ENST00000392370 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 U8.2-201ENST00000363156 134 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 FAM206A-202ENST00000374624 499 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 DEFB125-201ENST00000382410 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 SNRPEP10-201ENST00000420249 274 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 RPL31P63-201ENST00000422565 375 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MTCO3P18-201ENST00000440206 761 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 KRTAP13-6P-201ENST00000508999 371 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC023796.2-201ENST00000545410 451 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC026371.1-201ENST00000551867 419 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 EIF4A1P12-201ENST00000551910 141 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC007347.1-201ENST00000563879 281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC024614.2-201ENST00000577584 372 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 MIR3672-201ENST00000584290 82 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 ZNF616-202ENST00000596290 568 ntTSL 4 BASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AL138726.1-201ENST00000614873 333 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
TRADDQ15628 AC092881.1-201ENST00000638218 2733 ntBASIC1.84□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 KTN1-204ENST00000395311 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 MIR340-201ENST00000362125 95 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 SNORD114-6-201ENST00000364393 72 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 Y_RNA.332-201ENST00000365271 113 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 SNORA70B-201ENST00000384210 135 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RNA5SP501-201ENST00000410990 112 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 LINC02540-201ENST00000455554 570 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AL024497.2-201ENST00000457081 317 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RPS29P21-201ENST00000496272 170 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 MTCYBP18-201ENST00000501056 747 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC096736.2-201ENST00000507972 175 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 MTND1P5-201ENST00000517906 940 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC087441.2-201ENST00000529141 262 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 U4.5-201ENST00000617137 123 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC090617.10-201ENST00000624308 134 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC068137.4-201ENST00000638485 296 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 PI15-201ENST00000260113 6732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 CLDN10-202ENST00000376855 701 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 Y_RNA.530-201ENST00000384587 101 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 MIR9-3-201ENST00000385084 90 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AL513185.2-201ENST00000425543 193 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 TTTY16-201ENST00000437686 192 ntTSL 1 (best) BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 LINC01628-201ENST00000444266 397 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
TRADDQ15628 APOA2-205ENST00000468465 421 ntTSL 2 BASIC1.82□□□□□ -2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.8 ms