Protein–RNA interactions for Protein: Q15036

SNX17, Sorting nexin-17, humanhuman

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Length 470 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX17Q15036 AC068831.7-201ENST00000616954 363 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC073349.3-201ENST00000617616 186 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC024581.2-201ENST00000619986 252 ntBASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 AC068544.1-201ENST00000635064 248 ntTSL 5 BASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 NEB-201ENST00000172853 20634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.72□□□□□ -1.81
SNX17Q15036 CRISP3-204ENST00000433368 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 TOPORSLP1-203ENST00000493279 2871 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 KIAA0586-215ENST00000619722 5597 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU6-1130P-201ENST00000365434 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SNORD50.2-201ENST00000365465 70 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU6-142P-201ENST00000384019 107 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 MIR544A-201ENST00000384855 91 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 Y_RNA.597-201ENST00000410463 100 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC138623.1-201ENST00000418060 216 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 KCNJ6-AS1-201ENST00000435001 357 ntTSL 5 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AL353743.2-202ENST00000439544 473 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 IFNA11P-201ENST00000446352 526 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC006026.2-201ENST00000457376 180 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 snoU13.6-201ENST00000458785 104 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC107973.1-201ENST00000530249 576 ntTSL 4 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AP002004.1-207ENST00000531371 526 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC011602.1-201ENST00000546484 331 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 HSPE1P4-201ENST00000550617 308 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC107958.3-201ENST00000553410 431 ntTSL 3 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC055872.1-201ENST00000570978 278 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC005176.2-201ENST00000596933 147 ntBASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 DTHD1-202ENST00000456874 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 NDST3-201ENST00000296499 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 MYOT-208ENST00000515645 1578 ntTSL 2 BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC3.71□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 C5orf51-201ENST00000381647 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 HELZ-201ENST00000358691 13810 ntTSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNA5-8SP4-201ENST00000365096 150 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 RNU6-217P-201ENST00000384164 104 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 MIR186-201ENST00000384988 86 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 GPM6BP3-201ENST00000442797 145 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 AC013248.1-201ENST00000455092 232 ntTSL 3 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 MIR3145-201ENST00000580727 82 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 FTX_3.1-201ENST00000610451 147 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC022149.2-201ENST00000621061 203 ntBASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 EPS15-202ENST00000371730 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 PKHD1L1-201ENST00000378402 13076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 IL33-201ENST00000381434 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.7□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 TTN-204ENST00000360870 18218 ntTSL 5 BASIC3.7□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 GPRC6A-202ENST00000368549 2622 ntTSL 1 (best) BASIC3.69□□□□□ -1.82
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SNX17Q15036 CCSER2-201ENST00000224756 7664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 ZNF705G-201ENST00000400156 3644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.69□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 FAP-201ENST00000188790 2780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 IL23R-205ENST00000637002 2208 ntTSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 PCDH15-208ENST00000395432 6901 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 C6orf10-204ENST00000447241 2148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 NEB-218ENST00000603639 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 NEB-219ENST00000604864 25578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 ZNF804B-202ENST00000611114 3968 ntTSL 5 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 OR9K2-202ENST00000641329 3120 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 OR4M1-202ENST00000641200 3493 ntAPPRIS P1 BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 SPRR2E-201ENST00000368750 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU6-1117P-201ENST00000384525 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 MIR549A-201ENST00000385268 96 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RNU5E-9P-201ENST00000411164 104 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 AC074117.2-201ENST00000417130 397 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 OOSP1P1-201ENST00000423265 274 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 HMGB3P8-201ENST00000449709 577 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
SNX17Q15036 RN7SL863P-201ENST00000462370 296 ntBASIC3.68□□□□□ -1.82
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