Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 AL359238.1-201ENST00000557770 744 ntTSL 3 BASIC-0.37□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-1207P-201ENST00000384343 107 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR610-201ENST00000385139 96 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-177P-201ENST00000411257 104 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNX3P1X-201ENST00000414887 175 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL353777.1-201ENST00000425552 326 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL512656.1-201ENST00000427492 401 ntTSL 2 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL357793.2-201ENST00000447056 850 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RPS3AP17-201ENST00000472594 777 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC02484-202ENST00000514877 546 ntTSL 3 BASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-1041P-201ENST00000516254 102 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 Y_RNA.757-201ENST00000578934 114 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL929325.1-201ENST00000603096 117 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC-0.38□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA42.1-201ENST00000363515 137 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 C20orf187-201ENST00000378252 446 ntTSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-505P-201ENST00000384427 107 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR224-201ENST00000384889 81 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC012368.2-201ENST00000423539 560 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC092427.1-201ENST00000439177 601 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC01399-202ENST00000458450 244 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-714P-201ENST00000516963 103 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNY1P9-201ENST00000532431 109 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNRPGP1-201ENST00000553864 222 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC090948.3-201ENST00000606713 551 ntTSL 4 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC005696.2-201ENST00000610120 626 ntTSL 3 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 C8orf59-212ENST00000615697 483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC078938.1-201ENST00000620993 318 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 NUCB2-220ENST00000622082 1369 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC099654.9-201ENST00000637055 678 ntBASIC-0.39□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-674P-201ENST00000363831 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RNU6-40P-201ENST00000384254 107 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL034345.1-201ENST00000407768 123 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 TPMTP2-201ENST00000414372 726 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTCO1P19-201ENST00000443487 500 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 ELOCP30-201ENST00000447108 299 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC01755-201ENST00000455010 453 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC079943.2-201ENST00000488999 716 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC104629.1-201ENST00000494226 508 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 OR9P1P-201ENST00000496431 281 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC104136.1-201ENST00000512969 394 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORA40.12-201ENST00000516329 111 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC091163.3-201ENST00000518269 1144 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTND2P7-201ENST00000521337 640 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC011979.2-201ENST00000527568 352 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 ZNF519P3-201ENST00000557158 1032 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC122134.1-202ENST00000569111 1201 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MIR4764-201ENST00000580680 88 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC244093.3-201ENST00000615419 411 ntTSL 3 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 EIF2AK2-204ENST00000405334 1533 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL603865.2-201ENST00000401679 213 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL451046.2-201ENST00000403074 277 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 ZNF736P10Y-201ENST00000403990 1110 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 MTCYBP5-201ENST00000423752 1135 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC007991.2-201ENST00000520185 102 ntTSL 5 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AL445074.1-201ENST00000555362 318 ntTSL 2 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 LINC02290-203ENST00000556662 577 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 AC009558.1-201ENST00000561174 581 ntTSL 4 BASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SEPT14P17-201ENST00000617978 177 ntBASIC-0.4□□□□□ -2.47
SHPRHQ149N8 SNORD114-12-201ENST00000365400 75 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL354864.1-201ENST00000373226 539 ntTSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SNORA12.2-201ENST00000391040 156 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU4-27P-201ENST00000410889 139 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL391336.1-201ENST00000424678 484 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 ZNF385D-AS2-201ENST00000436306 424 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL512271.1-201ENST00000439878 434 ntTSL 3 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 EEF1A1P39-201ENST00000440791 250 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 LINC02462-201ENST00000503009 430 ntTSL 5 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 RNU6-760P-201ENST00000516078 97 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
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SHPRHQ149N8 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC-0.41□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 ZNF736P9Y-201ENST00000439586 1345 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC016831.2-201ENST00000417179 352 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MTND4LP11-201ENST00000422184 280 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MTCYBP10-201ENST00000424905 650 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AL356583.2-201ENST00000426536 280 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC016751.1-201ENST00000458254 306 ntTSL 3 BASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RPL39P36-201ENST00000490784 156 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SCARNA8-201ENST00000515924 131 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC112693.2-201ENST00000556538 232 ntBASIC-0.42□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU6-97P-201ENST00000363387 104 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SNORD111-201ENST00000408139 94 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 SNORA31.3-201ENST00000516029 96 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC027419.1-201ENST00000522976 328 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC107905.1-201ENST00000616204 426 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 MIR1264-201ENST00000616374 69 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 AC011155.2-201ENST00000623202 216 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
SHPRHQ149N8 RNU6-679P-201ENST00000391003 106 ntBASIC-0.43□□□□□ -2.48
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