Protein–RNA interactions for Protein: Q14162

SCARF1, Scavenger receptor class F member 1, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF1Q14162 SYCP2-201ENST00000357552 5567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 GABRG2-213ENST00000639046 3058 ntTSL 5 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MRE11-202ENST00000323977 2588 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNA5SP50-201ENST00000363731 107 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 Y_RNA.243-201ENST00000364481 109 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA18.3-201ENST00000384122 132 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA48.2-201ENST00000390926 124 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA48.5-201ENST00000391143 135 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA68.2-201ENST00000391263 128 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 FTH1P15-201ENST00000406984 280 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 NDUFB1P1-201ENST00000435191 180 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RPL32P34-201ENST00000486380 400 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC093534.2-201ENST00000511418 420 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU1-103P-201ENST00000516502 125 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC091178.2-201ENST00000584401 117 ntBASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC01068-202ENST00000620874 626 ntTSL 3 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 VPS13C-202ENST00000261517 13400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ZCCHC10-201ENST00000324170 2178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 GABPB1-AS1-202ENST00000499624 16182 ntTSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 HDX-202ENST00000373177 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CRB1-201ENST00000367397 9023 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 PMS1-215ENST00000447232 2576 ntTSL 2 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 OR13G1-202ENST00000642119 2568 ntAPPRIS P1 BASIC4.51□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 PCDH15-218ENST00000437009 6804 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 C1orf141-205ENST00000475209 2079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 KLF12-201ENST00000377669 10637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ADAM28-201ENST00000265769 7052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CLEC1B-204ENST00000428126 3054 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC073073.2-201ENST00000609827 2578 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ZNF99-201ENST00000397104 3114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORD87-201ENST00000364849 89 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC092660.1-201ENST00000420648 371 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC020594.1-201ENST00000437680 338 ntTSL 3 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC01198-202ENST00000458282 558 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RPS4XP2-201ENST00000458402 793 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORD105B-201ENST00000458770 79 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC103975.1-201ENST00000482506 483 ntBASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RTN4-208ENST00000404909 4102 ntTSL 1 (best) BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 KLHL13-208ENST00000541812 3102 ntTSL 2 BASIC4.5□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RFX7-201ENST00000559447 10426 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ZNF99-202ENST00000596209 7817 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 BIRC3-206ENST00000532808 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNY3P5-201ENST00000384127 102 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA51.10-201ENST00000384418 136 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNA5SP424-201ENST00000390988 115 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MIR1278-201ENST00000408753 81 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC115115.1-201ENST00000449927 248 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RN7SL601P-201ENST00000471221 293 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA70.18-201ENST00000516696 98 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORA31.20-201ENST00000517111 133 ntBASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC102945.1-201ENST00000522640 407 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC113192.5-201ENST00000528779 486 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC008739.1-201ENST00000598137 575 ntTSL 2 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 OR4C16-201ENST00000623907 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 EFCAB5-201ENST00000394835 5132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SYT16-205ENST00000568344 13978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 USH2A-202ENST00000366942 6320 ntTSL 1 (best) BASIC4.49□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 TLR8-202ENST00000311912 3367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 SNORD9-201ENST00000362566 104 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-309P-201ENST00000364573 106 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-144P-201ENST00000383951 107 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC00894-201ENST00000413076 403 ntTSL 3 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 DBIP2-201ENST00000419076 262 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC019205.3-201ENST00000424573 156 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RPS26P15-201ENST00000488067 348 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AL356575.1-201ENST00000603008 283 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC025166.1-201ENST00000612411 163 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MIR8058-201ENST00000615737 89 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 U2.21-201ENST00000637295 81 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AK9-204ENST00000424296 6326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AL589745.1-201ENST00000421190 3336 ntTSL 5 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 NEAT1-202ENST00000501122 22743 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 OFD1P6Y-202ENST00000451061 2724 ntBASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 PLOD2-204ENST00000461497 3043 ntTSL 2 BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ZNF483-201ENST00000309235 3655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CNTN5-207ENST00000527185 4303 ntTSL 1 (best) BASIC4.48□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 ADGRL2-205ENST00000370717 5873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 TRIM36-201ENST00000282369 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CCNH-206ENST00000508855 2391 ntTSL 1 (best) BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 MTND5P18-201ENST00000445624 1801 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 LINC00670-201ENST00000313495 2953 ntTSL 2 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-766P-201ENST00000362478 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-647P-201ENST00000364243 107 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-978P-201ENST00000364371 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 Y_RNA.328-201ENST00000365208 113 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 Y_RNA.346-201ENST00000365385 112 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNA5SP39-201ENST00000411245 120 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RNU6-592P-201ENST00000411333 103 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC004866.1-201ENST00000411748 78 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AL513008.1-201ENST00000412701 161 ntTSL 5 BASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 CYCSP4-201ENST00000429682 331 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 RPL26P9-201ENST00000457466 433 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC090525.1-201ENST00000479116 478 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
SCARF1Q14162 AC018630.3-201ENST00000542637 96 ntBASIC4.47□□□□□ -1.69
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