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| UBE4A | Q14139 | SNORD14D-201 | ENST00000384390 | 87 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| UBE4A | Q14139 | FGF7P8-201 | ENST00000402994 | 292 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| UBE4A | Q14139 | RN7SKP32-201 | ENST00000410167 | 303 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC006333.1-201 | ENST00000422401 | 410 nt | TSL 3 BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
| UBE4A | Q14139 | RPS27P27-201 | ENST00000498779 | 255 nt | BASIC | 2.78 | □□□□□ -1.96 | | |
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| UBE4A | Q14139 | MTND5P9-201 | ENST00000503854 | 1755 nt | BASIC | 2.77 | □□□□□ -1.97 | | |
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| UBE4A | Q14139 | MIR6873-201 | ENST00000622788 | 63 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC010297.1-201 | ENST00000623948 | 149 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | SCARNA4-201 | ENST00000629045 | 128 nt | BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | KTN1-214 | ENST00000554507 | 2057 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.76 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RNU6-593P-201 | ENST00000364716 | 112 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RNU6-596P-201 | ENST00000365395 | 98 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | MT-TL1-201 | ENST00000386347 | 75 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
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| UBE4A | Q14139 | HMGN2P18-201 | ENST00000450680 | 270 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC055764.1-201 | ENST00000454526 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC069528.1-201 | ENST00000490344 | 705 nt | TSL 3 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RPL23AP75-201 | ENST00000491601 | 451 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC116337.1-201 | ENST00000509680 | 687 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RNU6ATAC9P-201 | ENST00000516210 | 116 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
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| UBE4A | Q14139 | MIR3670-2-201 | ENST00000582974 | 65 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
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| UBE4A | Q14139 | AL355512.1-202 | ENST00000607952 | 209 nt | TSL 5 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | MIR3670-4-201 | ENST00000612260 | 65 nt | BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | TEX41-243 | ENST00000614173 | 190 nt | TSL 5 BASIC | 2.75 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC092881.1-201 | ENST00000638218 | 2733 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | SNORD50.1-201 | ENST00000362987 | 71 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
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| UBE4A | Q14139 | RNU2-41P-201 | ENST00000410991 | 178 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RPL21P111-201 | ENST00000418453 | 477 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | NCOR1P3-201 | ENST00000420479 | 303 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | MTND5P5-201 | ENST00000503764 | 376 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | LIAS-206 | ENST00000513731 | 826 nt | TSL 5 BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RNU6-1198P-201 | ENST00000516904 | 67 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | CR383656.11-201 | ENST00000552261 | 498 nt | TSL 3 BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | SNRPGP20-201 | ENST00000604477 | 205 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | uc_338.5-201 | ENST00000611839 | 155 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | ZEB2_AS1_1.1-201 | ENST00000621504 | 128 nt | BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | LINC00645-203 | ENST00000557399 | 3512 nt | TSL 1 (best) BASIC | 2.74 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | MIR518A2-201 | ENST00000384966 | 87 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | MIR1262-201 | ENST00000408276 | 93 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AL353743.2-202 | ENST00000439544 | 473 nt | TSL 3 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | RNU7-14P-201 | ENST00000459331 | 62 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AF186996.7-201 | ENST00000492781 | 209 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC025754.2-201 | ENST00000606491 | 432 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | DLEU2_5.1-201 | ENST00000615567 | 84 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC130454.1-201 | ENST00000622948 | 401 nt | BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | AC068631.1-220 | ENST00000630726 | 256 nt | TSL 5 BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | ENAM-201 | ENST00000396073 | 5679 nt | APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC | 2.73 | □□□□□ -1.97 | | |
| UBE4A | Q14139 | EYS-211 | ENST00000503581 | 10589 nt | APPRIS P3 TSL 5 BASIC | 2.72 | □□□□□ -1.97 | | |