Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 ZNRD1-AS1_3.8-201ENST00000611686 104 ntBASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ETDC-201ENST00000635820 180 ntAPPRIS P1 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ZNF451-208ENST00000491832 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MUC15-202ENST00000436318 3118 ntTSL 5 BASIC2.14□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC00645-203ENST00000557399 3512 ntTSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 Y_RNA.135-201ENST00000363439 95 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 Y_RNA.212-201ENST00000364177 102 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1013P-201ENST00000384180 107 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL590632.1-201ENST00000424289 371 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MTND4LP16-201ENST00000440828 295 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 NDUFAF4P4-201ENST00000454883 502 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC099518.4-202ENST00000576433 455 ntTSL 2 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC025754.2-201ENST00000606491 432 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC007014.2-201ENST00000615581 479 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 PCDH11Y-203ENST00000362095 4220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.13□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU5B-2P-201ENST00000363036 113 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 BTLA-202ENST00000383680 726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 SNORD116-11-201ENST00000383882 92 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 SNORA32.2-201ENST00000384049 122 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC009480.1-201ENST00000402410 412 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MTND1P11-201ENST00000456661 876 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC079804.2-201ENST00000490376 200 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC082651.2-201ENST00000496833 166 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LIAS-206ENST00000513731 826 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-273P-201ENST00000516937 96 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC01900-203ENST00000585185 393 ntTSL 3 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR3942-201ENST00000585264 109 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP003465.2-201ENST00000602571 373 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 TMEM154-204ENST00000613578 486 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC006504.8-201ENST00000621046 635 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 C16orf97-206ENST00000622950 415 ntTSL 2 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ZNF644-212ENST00000621077 2056 ntTSL 5 BASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.12□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 PTPRQ-209ENST00000616559 8165 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 XRCC4-205ENST00000511817 1636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 SNORD114-1-201ENST00000362705 72 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 PIGP-205ENST00000399103 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP450-201ENST00000411206 102 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 BX510359.4-201ENST00000423750 193 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 Z82205.1-201ENST00000428456 297 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 FTH1P25-201ENST00000447665 469 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-864P-201ENST00000516256 108 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 POLR3GP2-201ENST00000588366 668 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC019193.3-201ENST00000609144 554 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 DSCR8-208ENST00000614538 403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC01515-217ENST00000620859 694 ntTSL 5 BASIC2.11□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL596028.1-201ENST00000326971 197 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1164P-201ENST00000364428 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-438P-201ENST00000365561 103 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-831P-201ENST00000384548 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-160P-201ENST00000384591 107 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR517A-201ENST00000385001 87 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL513124.1-201ENST00000450410 614 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC025918.1-201ENST00000452467 383 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL034345.2-203ENST00000453417 383 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNA5SP182-201ENST00000516064 82 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC090592.1-203ENST00000533942 575 ntTSL 3 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR4287-201ENST00000579398 78 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR3945-201ENST00000581853 98 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AL022345.1-201ENST00000607292 135 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC130454.1-201ENST00000622948 401 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 hsa-mir-3158-1.1-201ENST00000637571 81 ntBASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIER3-204ENST00000381226 5210 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 THOC2-216ENST00000491737 4452 ntTSL 5 BASIC2.1□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 ZNF702P-202ENST00000434269 1966 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU1-58P-201ENST00000362413 163 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 MIR17-201ENST00000385012 84 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6ATAC25P-201ENST00000408798 117 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU6-1148P-201ENST00000410992 104 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RPS26P42-201ENST00000413485 326 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC107393.1-201ENST00000512403 346 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 LINC02061-201ENST00000514225 335 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP005660.1-201ENST00000522972 293 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AC114550.2-201ENST00000524008 397 ntTSL 3 BASIC2.09□□□□□ -2.07
ALCAMQ13740 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.09□□□□□ -2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.7 ms