Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 DLGAP1-AS4-201ENST00000582054 757 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RBM11P1-201ENST00000604951 799 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL121992.2-201ENST00000606262 256 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 LINC01206-214ENST00000610910 456 ntTSL 5 BASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MIR1321-201ENST00000637766 79 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTND5P10-201ENST00000603719 1809 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 ZNF680P1-201ENST00000436625 1469 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTND5P17-201ENST00000418405 1603 ntBASIC1.85□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Y_RNA.248-201ENST00000364501 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU4-12P-201ENST00000365233 139 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-483P-201ENST00000384088 108 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-606P-201ENST00000384721 111 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU11-3P-201ENST00000391111 133 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU6-1158P-201ENST00000391167 107 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNA5SP465-201ENST00000391195 109 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 SNORD115-47-201ENST00000391226 86 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AL591043.1-201ENST00000432461 424 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MTND1P18-201ENST00000448191 573 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MYCBP2-AS1-203ENST00000450627 349 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 PRELID3BP1-201ENST00000457142 540 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC116562.3-201ENST00000506136 177 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 SNORD27.1-201ENST00000516319 72 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC011257.1-201ENST00000519048 281 ntTSL 3 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 AC068587.5-201ENST00000528506 175 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 Z82243.1-201ENST00000609432 473 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 MIR3688-2-201ENST00000636963 87 ntBASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 KLRA1P-202ENST00000510134 1410 ntTSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.11
PTCH1Q13635 JMJD1C-212ENST00000639129 7901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.84□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 CUL2-206ENST00000421317 2376 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 snoU2_19.1-201ENST00000362361 80 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 SNORD114-27-201ENST00000363766 70 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 Y_RNA.367-201ENST00000365544 101 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU4-48P-201ENST00000365559 182 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR222-201ENST00000384992 110 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR625-201ENST00000385047 85 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR454-201ENST00000390180 115 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC068050.1-201ENST00000394891 380 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU2-9P-201ENST00000410194 145 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL590556.1-201ENST00000423231 483 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MRPS10P2-201ENST00000431226 381 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC000111.3-201ENST00000433478 193 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL356010.1-201ENST00000456364 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 FO393415.2-201ENST00000480085 343 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RPL30P1-201ENST00000488676 339 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC079943.1-201ENST00000491909 466 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 PTP4A1P4-201ENST00000512479 322 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC105417.1-201ENST00000514691 285 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-1178P-201ENST00000516674 107 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 Y_RNA.704-201ENST00000516851 102 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR4775-201ENST00000581168 75 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR4801-201ENST00000582704 82 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC113137.1-201ENST00000591869 558 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RMST_7.1-201ENST00000621935 268 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 FANCD2-213ENST00000625535 117 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-527P-201ENST00000363425 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-1090P-201ENST00000364065 94 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 Y_RNA.256-201ENST00000364594 104 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 Y_RNA.453-201ENST00000384223 109 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MIR1277-201ENST00000408536 78 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 EEF1A1P40-201ENST00000412883 573 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 FO680682.1-201ENST00000421261 345 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MTCO1P20-201ENST00000425366 358 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC005154.1-208ENST00000440438 353 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RBMX2P4-201ENST00000441256 376 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 SNRPGP13-201ENST00000442212 177 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RPL39P29-201ENST00000447779 157 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC004888.1-201ENST00000450480 547 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MTCO3P38-201ENST00000468910 766 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC092989.1-201ENST00000481235 277 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU1-86P-201ENST00000516108 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU1-107P-201ENST00000516617 154 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-965P-201ENST00000516721 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC145141.2-201ENST00000518473 501 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 IGLVVI-22-1-201ENST00000521183 211 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC139497.1-201ENST00000524042 501 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 LINC01495-202ENST00000534135 343 ntTSL 2 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 KTN1-214ENST00000554507 2057 ntTSL 1 (best) BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL139193.1-201ENST00000554967 539 ntTSL 4 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC023906.2-201ENST00000558343 462 ntTSL 3 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AP000907.4-201ENST00000604143 237 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC008536.2-201ENST00000607284 349 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC002553.4-201ENST00000616896 331 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 U1.36-201ENST00000620684 176 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AC109471.3-201ENST00000625219 233 ntTSL 5 BASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 U6.114-201ENST00000636407 96 ntBASIC1.83□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-1283P-201ENST00000365314 105 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 Y_RNA.381-201ENST00000365666 102 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 SNORD14D-201ENST00000384390 87 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 SNORA8-201ENST00000384574 139 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 BTF3L4P2-201ENST00000392798 346 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 RNU6-908P-201ENST00000410160 94 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 MTND1P2-201ENST00000430604 821 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
PTCH1Q13635 AL596276.1-201ENST00000434465 418 ntBASIC1.82□□□□□ -2.12
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