Protein–RNA interactions for Protein: Q13601

KRR1, KRR1 small subunit processome component homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRR1Q13601 AC126323.6-201ENST00000561701 451 ntTSL 3 BASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC025917.1-202ENST00000566344 635 ntTSL 5 BASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 TMF1P1-201ENST00000576058 373 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MIR5000-201ENST00000577717 103 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC112187.2-201ENST00000604345 283 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC013244.3-201ENST00000605614 388 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC080013.3-201ENST00000606839 578 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 GHRLOS.1-201ENST00000610995 70 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 C8orf59-207ENST00000611854 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MIR5087-201ENST00000635826 76 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL450472.1-202ENST00000637286 180 ntBASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 MGST1-207ENST00000535309 1331 ntTSL 1 (best) BASIC0.35□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 AL442644.1-201ENST00000454390 3105 ntBASIC0.34□□□□□ -2.35
KRR1Q13601 RNU6-945P-201ENST00000383947 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 LANCL1-AS1-202ENST00000420418 476 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC009299.3-201ENST00000421122 1072 ntTSL 3 BASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC244023.1-201ENST00000426884 112 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 HMGN2P34-201ENST00000437647 269 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 TAF9P1-201ENST00000445421 515 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 TAF9P2-201ENST00000454958 515 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU2-34P-201ENST00000516534 121 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 PWRN1-203ENST00000564898 389 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL390123.1-201ENST00000603216 237 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 Z83818.1-201ENST00000603584 150 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC080078.2-201ENST00000603766 501 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC242498.1-201ENST00000604134 111 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 ST7-OT4_1.1-201ENST00000615322 200 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC243994.1-201ENST00000618627 109 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC106754.2-201ENST00000623006 233 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 UGP2-230ENST00000626380 276 ntTSL 5 BASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC134026.1-201ENST00000623249 2239 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 ELL2P3-201ENST00000457883 1602 ntBASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC0.34□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 DEUP1-201ENST00000298050 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC092268.1-201ENST00000342691 405 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-37P-201ENST00000362692 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-428P-201ENST00000362942 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 Y_RNA.164-201ENST00000363709 102 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-11P-201ENST00000364234 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-25P-201ENST00000383873 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-1-201ENST00000383898 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-48P-201ENST00000384161 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-36P-201ENST00000384172 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-4P-201ENST00000384205 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-5P-201ENST00000384238 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-3P-201ENST00000384314 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-16P-201ENST00000384385 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-15P-201ENST00000384534 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-1235P-201ENST00000384559 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-2-201ENST00000384627 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-29P-201ENST00000384637 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-9-201ENST00000384776 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-33P-201ENST00000384793 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 SNORD41-201ENST00000386967 70 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL590399.1-203ENST00000412631 256 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL133396.1-201ENST00000432048 687 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL358794.1-201ENST00000445689 381 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-498P-201ENST00000459468 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU4-57P-201ENST00000515980 135 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 CCDC7-208ENST00000537047 657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 Z98751.3-201ENST00000604447 521 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-6P-201ENST00000606623 107 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL158211.2-201ENST00000607282 395 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC116165.2-201ENST00000616705 206 ntBASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC138058.1-201ENST00000620572 449 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC244517.7-201ENST00000625144 398 ntTSL 3 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.33□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-552P-201ENST00000362869 119 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-61P-201ENST00000365528 109 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 MTATP6P20-201ENST00000414147 562 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 MTND3P1-201ENST00000441336 220 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 BBIP1-206ENST00000447005 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 GAPDHP17-201ENST00000449858 1001 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL162395.1-201ENST00000457882 422 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 LINC02155-201ENST00000519215 407 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AL137100.2-201ENST00000555786 315 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 LINC02301-203ENST00000555798 789 ntTSL 3 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC012557.2-201ENST00000605919 418 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC005520.5-201ENST00000613926 164 ntBASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 PPP2R2A-224ENST00000640787 318 ntTSL 5 BASIC0.32□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 Y_RNA.97-201ENST00000363094 102 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU4-1-201ENST00000363925 141 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 Y_RNA.287-201ENST00000364853 94 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-1335P-201ENST00000365426 107 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU6-1257P-201ENST00000384625 110 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 MIR1283-1-201ENST00000408494 87 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 C5orf58-201ENST00000421269 406 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 TIMM9P3-201ENST00000428659 274 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC092423.1-201ENST00000430165 186 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 SNAP23P1-201ENST00000433229 246 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 LINC00571-203ENST00000454060 525 ntTSL 3 BASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 RNU7-21P-201ENST00000459430 62 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
KRR1Q13601 SRRM1P2-201ENST00000464531 1192 ntBASIC0.31□□□□□ -2.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.4 ms