Protein–RNA interactions for Protein: Q13547

HDAC1, Histone deacetylase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC1Q13547 AC116563.1-201ENST00000505454 396 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LNX1-AS1-203ENST00000511989 488 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNA5SP454-201ENST00000517231 127 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 TMCO5B-203ENST00000529623 509 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MRPS36P4-201ENST00000534436 298 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 NDUFA5P6-201ENST00000542110 379 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC124303.1-201ENST00000605703 360 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL161423.1-201ENST00000613700 262 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC026523.1-201ENST00000617221 490 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 HOXA11-AS1_4.1-201ENST00000620901 233 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL359757.2-201ENST00000624309 274 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 CTSLP2-204ENST00000629029 392 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 U3.9-201ENST00000363823 204 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORD32B-201ENST00000364460 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.384-201ENST00000383909 102 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORA29-201ENST00000384183 140 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-378P-201ENST00000384324 107 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNA5SP201-201ENST00000410316 124 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU2-48P-201ENST00000410694 191 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 HNRNPDLP1-201ENST00000412834 550 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AF228730.4-201ENST00000421457 183 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC069540.2-201ENST00000441776 351 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL513328.1-201ENST00000446460 224 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORD19B-201ENST00000459623 84 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC020703.1-201ENST00000505051 521 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SEMA6A-AS1-204ENST00000510682 521 ntTSL 5 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC025871.1-202ENST00000518819 432 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP005639.2-201ENST00000527592 928 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP001825.1-201ENST00000534275 351 ntTSL 2 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC016256.1-201ENST00000547971 354 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 FRG2DP-202ENST00000566967 323 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC026271.5-201ENST00000577873 130 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR3162-201ENST00000581818 82 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL031274.2-201ENST00000599419 203 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 PCGEM1.1-201ENST00000613431 131 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL132822.1-201ENST00000617063 513 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR1248-201ENST00000629190 106 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RGPD1-204ENST00000559485 5247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SCOC-201ENST00000338517 1864 ntTSL 4 BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ENAM-201ENST00000396073 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 TAB3-205ENST00000378933 6671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 CYLC1-201ENST00000329312 2106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 OR8K3-204ENST00000641689 2380 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.138-201ENST00000363462 102 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-1286P-201ENST00000383871 107 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-611P-201ENST00000384276 104 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORD116-29-201ENST00000384516 83 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNA5SP494-201ENST00000410653 129 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC093382.1-201ENST00000413311 379 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL139396.1-201ENST00000421137 167 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 DAP3P1-201ENST00000441522 278 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC005703.2-201ENST00000453339 343 ntTSL 2 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ATP1B3-AS1-201ENST00000492725 376 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MTND5P5-201ENST00000503764 376 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC107222.1-201ENST00000510899 637 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ACA59.1-201ENST00000515966 143 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-559P-201ENST00000516151 98 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU7-193P-201ENST00000516723 65 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC021785.1-201ENST00000520780 453 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 LINC02055-204ENST00000521034 432 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC027018.1-202ENST00000534723 383 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC233702.2-202ENST00000562547 291 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC074050.1-201ENST00000563247 211 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MIR4790-201ENST00000577799 79 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNRPGP17-201ENST00000603780 214 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL160408.5-201ENST00000607759 526 ntTSL 4 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MTND4LP32-201ENST00000636111 270 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 OR2L2-203ENST00000642011 4225 ntAPPRIS P1 BASIC2.86□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ATF1-201ENST00000262053 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL161668.1-201ENST00000320322 358 ntTSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.259-201ENST00000364619 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-1227P-201ENST00000383981 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.431-201ENST00000384086 102 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-784P-201ENST00000384330 106 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-1093P-201ENST00000391194 107 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC074085.1-201ENST00000413598 418 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MTCYBP6-201ENST00000441810 138 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 MTND1P17-201ENST00000448961 204 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL353705.4-201ENST00000449661 238 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AL137159.1-201ENST00000452808 512 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 Y_RNA.635-201ENST00000459041 101 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RN7SL636P-201ENST00000497504 294 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP003123.1-201ENST00000526041 333 ntTSL 2 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP003715.1-201ENST00000532109 435 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP000654.2-201ENST00000605633 586 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC012640.5-201ENST00000623897 319 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC233981.2-201ENST00000611524 1614 ntBASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ARHGAP28-204ENST00000419673 5492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.85□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AP006437.1-201ENST00000641440 3685 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 ZNF720P1-201ENST00000562403 1939 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 KPNA5-202ENST00000368564 11311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC069228.1-201ENST00000546936 1615 ntTSL 3 BASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 SNORD115-3-201ENST00000363100 82 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 RNU6-1304P-201ENST00000411374 106 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
HDAC1Q13547 AC236972.2-201ENST00000434979 310 ntBASIC2.84□□□□□ -1.95
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