Protein–RNA interactions for Protein: Q13536

C1orf61, Protein CROC-4, humanhuman

Predictions only

Length 156 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf61Q13536 RNU2-41P-201ENST00000410991 178 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNA5SP247-201ENST00000411181 105 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL669831.2-201ENST00000422528 456 ntTSL 5 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL606489.2-201ENST00000433886 234 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL138799.4-201ENST00000443939 643 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC007395.1-201ENST00000451333 677 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL354733.1-201ENST00000458016 476 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 TPTE2P5-203ENST00000458118 728 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU7-14P-201ENST00000459331 62 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-261P-201ENST00000459506 102 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 U8.21-201ENST00000459536 136 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC130509.1-201ENST00000464158 433 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC091874.1-201ENST00000511402 339 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU1-92P-201ENST00000517017 135 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC087518.1-201ENST00000524098 187 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL358937.1-201ENST00000524512 336 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009107.1-201ENST00000561923 330 ntTSL 3 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC006362.1-201ENST00000567392 174 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RBBP8-210ENST00000581687 617 ntTSL 2 BASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009994.1-201ENST00000606889 253 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC068944.2-201ENST00000610373 403 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 uc_338.5-201ENST00000611839 155 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MESTIT1_1.1-201ENST00000618871 140 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC103705.1-201ENST00000619013 241 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 VPS13A-206ENST00000376646 2262 ntTSL 5 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-227P-201ENST00000362865 103 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 ARL5AP1-201ENST00000418991 388 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL136369.2-201ENST00000420825 537 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL353193.1-201ENST00000421444 268 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC139712.2-201ENST00000424302 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 HSPE1P21-201ENST00000438283 308 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC133865.1-201ENST00000438619 339 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009474.2-201ENST00000451383 136 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AMD1P1-201ENST00000457220 922 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 PPP1R2P5-201ENST00000457256 603 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC005062.1-201ENST00000457921 566 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC091885.1-201ENST00000506658 268 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CCDC34P1-201ENST00000507441 517 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC008852.1-201ENST00000510198 451 ntTSL 2 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORD60.2-201ENST00000516883 86 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-612P-201ENST00000516909 102 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AP001001.1-201ENST00000532422 826 ntTSL 3 BASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC090517.1-201ENST00000569307 266 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AP001330.5-201ENST00000607176 411 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC073534.2-201ENST00000620377 381 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL359697.1-201ENST00000624879 587 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORA43.4-201ENST00000629559 138 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC242426.3-202ENST00000607149 2397 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU1-76P-201ENST00000362903 159 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNU6-1322P-201ENST00000364309 107 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 NPS-201ENST00000398023 270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MIR1304-201ENST00000408243 91 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 TRAPPC2P3-201ENST00000443200 321 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 NMTRQ-TTG12-1-201ENST00000467595 72 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC083798.1-201ENST00000472671 131 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC021146.2-201ENST00000504736 556 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 FAM206BP-201ENST00000510179 541 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 ATP5EP1-201ENST00000510257 156 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC079140.3-201ENST00000511111 550 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RNA5SP401-201ENST00000515920 127 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 Y_RNA.688-201ENST00000516565 95 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 CENPUP1-201ENST00000526649 1202 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 RN7SKP299-201ENST00000606679 301 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC139792.3-201ENST00000623525 224 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AP3S1-209ENST00000640413 489 ntTSL 5 BASIC1.48□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MUC15-203ENST00000455601 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTND5P9-201ENST00000503854 1755 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL391987.6-201ENST00000305671 199 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 Y_RNA.132-201ENST00000363421 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORD73A-201ENST00000386062 65 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC004965.1-201ENST00000413033 213 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MS4A4E-203ENST00000425663 350 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MTCO3P46-201ENST00000425787 232 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL445259.1-203ENST00000427828 251 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL354695.1-201ENST00000427935 228 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 INTS6L-AS1-201ENST00000430820 398 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC097473.1-201ENST00000508142 408 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 LINC02514-201ENST00000509058 498 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 SNORA31.24-201ENST00000517232 57 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC009754.1-201ENST00000566282 540 ntTSL 4 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL158211.1-201ENST00000566763 763 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AC092747.3-201ENST00000603769 301 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 AL355512.1-202ENST00000607952 209 ntTSL 5 BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 ST7-OT4_2.1-201ENST00000619089 172 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 ZNF209P-201ENST00000593450 2304 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 FGF7-202ENST00000560270 1688 ntTSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
C1orf61Q13536 MGAT4C-207ENST00000552808 1937 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.46□□□□□ -2.18
C1orf61Q13536 SEMG1-201ENST00000372781 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.46□□□□□ -2.18
C1orf61Q13536 SNORA7.1-201ENST00000363750 139 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 122.9 ms