Protein–RNA interactions for Protein: Q13428

TCOF1, Treacle protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCOF1Q13428 RPL23AP30-201ENST00000432419 501 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC011891.1-201ENST00000437088 432 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 FABP5P4-201ENST00000437203 171 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC00446-202ENST00000438327 357 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC104982.1-201ENST00000478775 574 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC074124.1-201ENST00000502368 375 ntTSL 3 BASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTCO3P9-201ENST00000506989 781 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU2-10P-201ENST00000516375 211 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU5F-4P-201ENST00000516581 114 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR4768-201ENST00000585270 74 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL034555.1-201ENST00000604816 211 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AP001596.2-201ENST00000608410 312 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC009509.4-201ENST00000619202 509 ntBASIC0.25□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 Y_RNA.185-201ENST00000363894 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 TSHB-202ENST00000369517 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-969P-201ENST00000383900 105 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC009313.1-201ENST00000425470 503 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTCYBP39-201ENST00000437562 491 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC00448-201ENST00000438352 402 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL591501.1-201ENST00000439992 495 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL035634.1-201ENST00000446768 372 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL157400.4-201ENST00000455699 667 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC091770.1-201ENST00000456513 373 ntTSL 2 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU7-34P-201ENST00000459394 64 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RPS26P48-201ENST00000491713 339 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC093895.1-203ENST00000506814 591 ntTSL 5 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-947P-201ENST00000516264 106 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC025524.2-207ENST00000520097 506 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC027701.1-201ENST00000520155 823 ntTSL 3 BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC007834.2-201ENST00000536310 343 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR5093-201ENST00000583199 100 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 FBXW7-AS1-201ENST00000605147 372 ntTSL 1 (best) BASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL359547.2-201ENST00000615810 418 ntBASIC0.24□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU4-56P-201ENST00000364700 142 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-950P-201ENST00000384651 107 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AP000473.1-201ENST00000413645 550 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTND4P3-201ENST00000417829 541 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC060773.1-201ENST00000421698 310 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL359081.1-201ENST00000432083 615 ntTSL 2 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC002486.1-201ENST00000435098 391 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC025947.1-201ENST00000447943 299 ntTSL 5 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC002350.1-201ENST00000490759 375 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RPS23P5-201ENST00000495419 428 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC011406.1-201ENST00000512440 370 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-1098P-201ENST00000516772 96 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC02398-201ENST00000536666 431 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 PWRN1-205ENST00000565295 465 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR3923-201ENST00000579521 83 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AP006219.1-201ENST00000580258 472 ntTSL 3 BASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC025627.3-201ENST00000582078 182 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORD98-201ENST00000636377 67 ntBASIC0.23□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-462P-201ENST00000362659 105 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-560P-201ENST00000364007 108 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-348P-201ENST00000384386 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTCYBP2-201ENST00000407745 171 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-1245P-201ENST00000411130 106 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 HIGD1AP15-201ENST00000416198 280 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 UBE2D3P3-201ENST00000426992 425 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL035398.1-201ENST00000430869 322 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC092625.1-201ENST00000442706 393 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC016925.1-201ENST00000458303 298 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU7-90P-201ENST00000459216 62 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC113347.3-201ENST00000509113 148 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 GTF2H2C-212ENST00000512736 832 ntTSL 1 (best) BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 IGLVI-20-201ENST00000519296 130 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC02425-201ENST00000536217 376 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC090888.2-201ENST00000559765 1144 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORA59B-202ENST00000578183 701 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC01893-201ENST00000581750 479 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RPL17P51-201ENST00000605218 238 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL360219.1-201ENST00000610230 366 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTND4P14-201ENST00000435799 1354 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 CASC19-280ENST00000642102 1351 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-384P-201ENST00000364900 104 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORA72.2-201ENST00000365028 127 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-1237P-201ENST00000384777 107 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MTCO2P12-201ENST00000427426 682 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC00189-202ENST00000431661 308 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 DPP10-AS2-201ENST00000446992 624 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AL121580.1-201ENST00000449941 219 ntTSL 3 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC010531.2-201ENST00000465012 153 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 MIR4742-201ENST00000581069 85 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 TTK-211ENST00000627129 240 ntTSL 5 BASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 SNORD3E-202ENST00000627253 216 ntBASIC0.22□□□□□ -2.37
TCOF1Q13428 RNU6-534P-201ENST00000364877 106 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU5E-7P-201ENST00000365290 117 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-877P-201ENST00000383868 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNU6-30P-201ENST00000384561 107 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL592431.2-201ENST00000422198 171 ntTSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RPEP5-201ENST00000441137 268 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 RNA5SP216-201ENST00000516111 123 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 SKP1-203ENST00000517625 876 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 HTN3-205ENST00000530128 775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC021231.3-201ENST00000558497 370 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 MIR3146-201ENST00000580367 79 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC110760.3-201ENST00000598794 467 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AL357075.2-201ENST00000614906 189 ntBASIC0.21□□□□□ -2.38
TCOF1Q13428 AC090625.1-201ENST00000357130 210 ntBASIC0.2□□□□□ -2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103.1 ms